高分辨飞行时间质谱在蛋白质组学相对定量分析中的应用
Application of High Resolution Time-of-Flight Mass Spectroscopy in Relative Quantitative Analysis in Proteomics作者机构：深圳大学生命科学学院微生物工程重点实验室 深圳大学生命与海洋科学学院深圳市海洋生物资源与生态环境重点实验室
出 版 物：《分析化学》 (Chinese Journal of Analytical Chemistry)
年 卷 期：2016年第44卷第3期
页 面：403-408页
核心收录：
学科分类：0710[理学-生物学] 071010[理学-生物化学与分子生物学] 07[理学] 070302[理学-分析化学] 0703[理学-化学]
基 金：深圳市科技项目(Nos.JSGG20140703163838793 20150006)资助
主 题：定量蛋白质组学 高分辨飞行时间质谱 打击计数 信号强度 无标记定量
摘 要：利用Triple TOF 5600高分辨质谱仪分析牛血清白蛋白等3种蛋白质标准品,研究了质谱离子强度与蛋白质样品相对含量的相关性。蛋白质标准品用胰酶酶切后,稀释成1;024 fmol/7μL的系列溶液,考察在1;024 fmol上样量情况下,肽段的前体离子计数（cps）、蛋白质全部肽段的离子计数之和以及被检出肽段数目与上样量的相关性,以及相同样品在3次平行实验之间这些数值的变化幅度。结果表明。被检出肽段数目与上样量正相关,当cps超过1000时,所有肽段离子强度之和与上样量呈线性关系,但是用最灵敏肽段的离子强度表示更为准确。3次测量同一肽段的最高离子强度通常不会超过最低强度的1.5倍,提示当不同样品中同一蛋白的离子强度相差3倍以上是判断不同样品中相同蛋白质的含量具有差异的可靠阈值。本研究提供了一种利用高分辨率和高扫描速度蛋白质组组学定性数据进行半定量分析的方法,简便、快速,可为相关生物学和医学研究提供参考。
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