中间球海胆Y-box基因分子特性和表达分析

作     者：田燚 张丙龙 常亚青 董萍萍 

作者机构：大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点开放实验室 

出 版 物：《水产学报》 (Journal of Fisheries of China)

年 卷 期：2013年第37卷第3期

页      面：376-389页

核心收录：

学科分类：0908[农学-水产] 09[农学] 

基　　金：国家“八六三”高技术研究发展计划(2012AA10A412) 水产种质资源与养殖技术重点开放实验室开放课题 

主　　题：海胆 Y-box基因 克隆 表达 

摘      要：为获得Y-box蛋白在中间球海胆的生物学功能,实验克隆了中间球海胆Y-box基因的全长cDNA,并进行了定量表达模式分析。Y-box基因全长cDNA为2 425 bp,该序列具有一个81 bp的5’非编码区,1 348 bp 3’非编码区,ORF为996 bp,cDNA编码331个氨基酸的前体蛋白,预测蛋白分子质量为37.4 ku,理论等电点是8.55,属于亲水性蛋白。中间球海胆Y-box前体蛋白的氨基酸序列包含3个结构域:氨基酸N末端,亲水结构域C末端和冷休克结构域(cold shock domain CSD),其中CSD区为Y-box蛋白家族中保守结构域。海胆Y-box蛋白质二级结构中无规则卷曲占88.22%,延伸链占9.97%,α-螺旋1.98%,无-折叠。氨基酸序列与其他物种氨基酸序列的同源性为22.37%～41.26%,在保守结构域CSD区同源性达到75%以上。实时定量PCR检测,Y-box基因在中间球海胆体腔液、管足、围口膜、雄性性腺、雌性性腺、肌肉和肠7个不同组织中均有表达,但差异不显著。温度胁迫下,中间球海胆Y-box基因的表达均表现为下调,并且随着温度的升高,Y-box基因的表达量呈现逐渐下降的趋势。