布莱克韦尔虫草实时荧光定量逆转录PCR内参基因的筛选

作     者：李佳妮 张姝 张永杰 LI Jiani;ZHANG Shu;ZHANG Yongjie

作者机构：山西大学生命科学学院山西太原030006 农业农村部农业微生物资源收集与保藏重点实验室北京100081 

出 版 物：《微生物学通报》 (Microbiology China)

年 卷 期：2025年第52卷第1期

页      面：219-229页

核心收录：

学科分类：1008[医学-中药学(可授医学、理学学位)] 1006[医学-中西医结合] 100602[医学-中西医结合临床] 10[医学] 

基　　金：农业农村部农业微生物资源收集与保藏重点实验室开放基金(KLMRCP2023-01) 山西省基础研究计划(202203021221036) 

主　　题：布莱克韦尔虫草 内参基因 RT-qPCR 

摘      要：【背景】实时荧光定量逆转录PCR(real-time quantitative reverse transcription PCR,RT-qPCR)常用于分析基因表达,但选择合适的内参基因,对分析结果的稳定性非常重要。布莱克韦尔虫草是一种具有开发价值的虫草,研究其功能基因表达具有重要意义。【目的】筛选获得布莱克韦尔虫草不同生长阶段(液体发酵菌丝体、小麦粒培养基菌丝体及子实体)最稳定的内参基因。【方法】选取8个候选内参基因(18S rRNA、gapdh、β-tubulin、cyclophilin A、γ-actin、rpl10、tef1α和ubiquitin),采用RT-qPCR技术进行扩增,结合geNorm、NormFinder、BestKeeper、ΔC_(t)等算法,评估这些基因在布莱克韦尔虫草不同生长发育阶段的表达稳定性。【结果】相比其他基因,γ-actin和18S rRNA在不同生长发育阶段的表达稳定性最好,可作为布莱克韦尔虫草基因表达分析的内参基因。【结论】本研究筛选出了布莱克韦尔虫草RT-qPCR的内参基因,为深入研究生长发育过程中的基因表达规律奠定了基础。