鸡miR-203a的生物信息学分析及其对黑色素沉积作用

作     者：耿晓文 徐硕辉 张志远 侯英东 何富民 李闯 李文婷 李东华 

作者机构：河南农业大学动物科技学院 河南省鸡种质资源创新与利用重点实验室 

出 版 物：《河南农业大学学报》 (Journal of Henan Agricultural University)

年 卷 期：2025年

学科分类：0905[农学-畜牧学] 09[农学] 

基　　金：国家自然科学基金青年项目(32102540) 河南农业大学青年科技创新基金项目(KJCX2021A09) 

主　　题：淅川乌骨鸡 miR-203a 进化分析 靶基因 表达分析 

摘      要：【目的】探索鸡miRNA-203a在黑色素沉积过程中潜在的作用机制。【方法】通过miRbase数据库获取miRNA-203a的成熟体序列，利用MEGA11软件构建miRNA-203a的系统进化树，采用TargetScan和miRDB在线工具预测鸡miRNA-203a的靶基因，并对其进行GO和KEGG富集分析；利用实时荧光定量PCR（quantitative Real-time polymerase chain reaction，RT-qPCR）检测miRNA-203a在淅川乌骨鸡和固始鸡背肤，以及在淅川乌骨鸡不同组织或器官中的表达量；在黑色素细胞中对miRNA-203a进行过表达和干扰后，利用RT-qPCR检测miR-203a的靶基因丝裂原活化蛋白激酶10基因（mitogen-activated protein kinase 10，MAPK10）的表达水平。【结果】miR-203a在不同物种间高度保守，经系统进化树序列比对分析，鸡miR-203a与斑马鱼的亲缘关系较近，与大鼠和人亲缘关系较远，预测得到鸡miR-203a有150个靶基因。GO功能富集分析表明，miR-203a靶基因主要富集在基因表达调控、生长因子应答和大分子代谢过程调控等过程；KEGG通路富集显示，miR-203a靶基因显著富集于MAPK信号通路、焦点黏附、Wnt信号通路等。miR-203a在固始鸡背肤中的表达量显著高于淅川乌骨鸡；通过淅川乌骨鸡不同组织或器官表达谱分析，miR-203a在背肤中的表达量最高，肾脏和心脏次之，均显著高于肝脏和脾脏。在黑色素细胞中过表达miRNA-203a，靶基因MAPK10表达量显著下降，干扰miR-203a后，MAPK10表达量显著上升。【结论】miR-203a在物种进化过程中高度保守，在黑色素细胞中起负调控作用，可能通过负调控MAPK10基因进而调节MAPK及Wnt等多条信号通路。