基于全转录组测序探讨褪黑素抑制神经胶质瘤细胞增殖的机制

作     者：徐丽 陈秀娇 郑伟男 毛馨琳 林丽彬 谢群 金清东 

作者机构：莆田学院基础医学院 莆田学院基础医学院肿瘤转化医学福建省高校重点实验室 莆田市第一医院神经外科 

出 版 物：《中国药理学通报》 (Chinese Pharmacological Bulletin)

年 卷 期：2024年

页      面：163-170页

核心收录：

学科分类：1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 1006[医学-中西医结合] 100706[医学-药理学] 100602[医学-中西医结合临床] 10[医学] 

基　　金：福建省自然科学基金项目(No 2023 J0 11725) 莆田市科技计划项目(No 2022SY001) 莆田学院校内科研项目(No2021048) 

主　　题：褪黑素 神经胶质瘤 全转录组测序 ceRNA网络 hsa-miR-129-5p hsa-miR-362-5p 

摘      要：目的 全转录组测序检测神经胶质瘤细胞非编码RNA（ncRNA）表达谱并构建ceRNA网络,揭示ncRNA参与褪黑素抑制神经胶质瘤细胞增殖的分子机制。方法 0、2、4、6、8 mmol·L-1褪黑素干预神经胶质瘤细胞24、48、72 h,CCK-8检测褪黑素对细胞增殖的抑制作用;0、4 mmol·L-1褪黑素干预U251细胞24h后,全转录组测序检测差异表达miRNA（DEmiRNA）、lncRNA （DElncRNA）、mRNA （DEmRNA）,对DEmRNA进行GO和KEGG富集分析;构建ceRNA网络,采用qRT-PCR验证ceRNA关键基因表达。结果 褪黑素呈时间-剂量依赖性抑制神经胶质瘤细胞增殖;全转录组测序筛选出0 mmol·L-1与4 mmol·L-1褪黑素组DEmRNA 5049个、DElncRNA 635个、DEmiRNA 146个;DEmRNA主要富集在铁死亡、mTOR信号通路、FoxO信号通路、细胞周期等癌症相关信号通路;ceRNA网络包含4个lncRNA、3个miRNA和48个mRNA,qRT-PCR验证U251细胞hsa-miR-129-5p、hsa-miR-362-5p、LINC00707和SLC16A1-AS1表达与测序结果一致,U87细胞的基因表达与测序结果基本一致。结论 褪黑素通过ncRNA差异表达,影响癌症相关信号通路,进而抑制神经胶质瘤细胞增殖;LINC00707、SLC16A1-AS1、hsa-miR-129-5p、hsa-miR-362-5p构成的ceRNA网络可能参与褪黑素抑制神经胶质瘤细胞增殖的分子机制。