徐淮山羊PPAR基因cDNA的克隆和生物信息学分析

作     者：秦玉蓉 许峰 田智泉 高波 张振韬 阴彦辉 孙敏 李碧春 

作者机构：扬州大学动物科学与技术学院江苏扬州225009 

出 版 物：《江苏农业科学》 (Jiangsu Agricultural Sciences)

年 卷 期：2011年第39卷第2期

页      面：59-61页

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 0836[工学-生物工程] 090102[农学-作物遗传育种] 

基　　金：国家转基因重大专项(编号:2008ZX08008-003 2009ZX08008-003B) 

主　　题：徐淮山羊 过氧化氢酶体激活增殖受体 cDNA 克隆 生物信息学 

摘      要：为克隆徐淮山羊过氧化氢酶体激活增殖受体(PPAR)基因的cDNA,探讨徐淮山羊PPAR基因的生物信息学功能。根据GenBank中发表的绵羊PPAR基因序列,设计并合成1对引物,采用RT-PCR方法克隆徐淮山羊脂肪组织中PPAR基因cDNA,提交GenBank,并运用DNAStar软件及在线工具进行生物信息学分析。成功克隆出徐淮山羊PPAR基因的编码区全序列cDNA,大小为1 428 bp,GenBank登录号为GU082382,有起始密码子ATG和终止密码子TAG,编码475个氨基酸;徐淮山羊PPAR基因序列与鸡、鼠、猪、牛、绵羊相应编码区(CDS)的同源性分别为81%、89%、92%、98%、99%,徐淮山羊PPAR氨基酸序列与鸡、鼠、猪、牛、绵羊的PPAR氨基酸序列同源性分别为92.9%、97.3%、98.3%、99.6%、99.8%;PPAR蛋白无信号肽区域,属于非分泌型蛋白。