基于数据挖掘的缺氧调控铁死亡参与结肠癌发生机制研究

作     者：杨光 田瑶 谢寒丹 YANG Guang;TIAN Yao;XIE Handan

作者机构：江汉大学医学部湖北武汉430056 

出 版 物：《江汉大学学报（自然科学版）》 (Journal of Jianghan University：Natural Science Edition)

年 卷 期：2024年第52卷第6期

页      面：77-86页

学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

基　　金：江汉大学校级学生科研项目(2023yb167) 

主　　题：数据挖掘 铁死亡 缺氧 结肠癌 作用机制 

摘      要：目的基于数据挖掘技术,探讨在缺氧条件下铁死亡参与结肠癌的机制。方法以TCGA-COAD为实验队列,GSE39582为验证队列。根据174个缺氧相关基因和517个铁死亡相关基因,通过Cox和LASSO回归分析构建风险评分预后模型,将数据中所有病患区分为高风险组和低风险组。随后进一步对两个风险组之间的临床和免疫特征进行综合分析,最后进行高低风险组之间的差异基因与结肠癌的GO(BP、MF、CC)和KEGG富集分析。结果构建了包含9个基因(CDKN2A、FNDC5、ENO3、GSTM1、JDP2、ANGPTL4、ANKZF1、TKTL1、PPARGC1A)的风险评分模型。与高风险组相比,低风险组预后较佳,且高风险组的免疫细胞浸润水平高于低风险组。通过对高低风险评分组之间的差异基因进行GO分析及KEGG通路富集分析显示与MAPK信号通路、Rap1信号通路、趋化因子信号通路等肿瘤及免疫相关通路密切相关。结论构建了缺氧条件下结合铁死亡的结肠癌患者风险评分模型,可为肿瘤的个体化治疗提供新的思路。