基于网络药理学与分子对接探究党参抗阿尔兹海默症的分子机制

作     者：陈巍 陈鸿儒 解举民 CHEN Wei;CHEN Hong-ru;XIE Ju-min

作者机构：湖北理工学院医学院湖北黄石435003 肾脏疾病发生与干预湖北省重点实验室湖北理工学院医学院湖北黄石435003 

出 版 物：《时珍国医国药》 (Lishizhen Medicine and Materia Medica Research)

年 卷 期：2024年第35卷第14期

页      面：3295-3304页

学科分类：1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 1006[医学-中西医结合] 100706[医学-药理学] 100602[医学-中西医结合临床] 10[医学] 

基　　金：湖北省中央引导地方科技发展专项(2022BCE054) 湖北理工学院科研重点项目(23xjz08A) 湖北理工学院·黄石大冶湖高新区大学科技园联合开放基金立项项目(23xjz04AK) 

主　　题：党参 阿尔兹海默症 网络药理学 分子机制 

摘      要：目的基于网络药理学与分子对接技术,探究党参治疗阿尔兹海默症的分子机制。方法在TCMSP、TCM-ID、BATMAN中药成分数据库获得党参主要药用成分。通过PharmMapper、Super-PRED、Swiss Target Prediction和ETCM平台获得党参成分靶点。运用GeneCards、OMIM、PharmGKB、DisGeNET疾病数据库获得阿尔兹海默症相关靶点。通过EVenn取交集获得党参与阿尔兹海默症的共同靶点,并使用Cytoscape3.8.1构建“党参-成分-靶点-阿尔兹海默症网络图。利用STRIING数据库开展靶点的PPI分析,使用Cytoscape 3.8.1可视化并筛选核心靶点。使用David数据库开展GO基因功能和KEGG信号通路富集分析。使用PyMoL 2.6.0、AutoDockTool 1.5.7和OpenBabel 2.4.1软件对核心靶点与活性成分开展分子对接。结果党参中的主要药用分子为川芎哚(Perlolyrine)、豆甾醇(Stigmasterol)和蒲公英赛醇(Taraxerol)。党参与阿尔兹海默症的交集靶点有88个,其中核心靶点5个,为EGFR、SRC、PAK2、IGF1R、PTPN11。GO基因功能分析发现,核心靶点参于生物过程(BP)42条,细胞组分(CC)12条,分子功能(MF)20条。KEGG信号通路富集分析发现,交集靶点参与细胞中149条信号通路。分子对接发现,SRC-蒲公英赛醇、JAK2-川芎哚、SRC-川芎哚、IGFR-川芎哚和IGFR-豆甾醇结合紧密,结合能较低。结论党参含有的川芎哚、豆甾醇和蒲公英赛醇等药用成分,通过多靶点、多途径等方式治疗阿尔兹海默症。