基于生物信息学分析筛选乙肝病毒感染相关性急性肝衰竭的潜在生物标志物

作     者：刘东 马晓虎 孙锦涵 张淑灵 LIU Dong;MA Xiaohu;SUN Jinhan;ZHANG Shuling

作者机构：宁夏医科大学医学信息与工程学院银川750004 宁夏医科大学创新创业学院银川750004 宁夏回族自治区中西医结合医院银川750021 宁夏医科大学总医院宁夏医科大学第一临床医学院银川750004 宁夏医科大学人文与管理学院银川750004 

出 版 物：《宁夏医科大学学报》 (Journal of Ningxia Medical University)

年 卷 期：2024年第46卷第10期

页      面：989-997,1009页

学科分类：1002[医学-临床医学] 100201[医学-内科学(含：心血管病、血液病、呼吸系病、消化系病、内分泌与代谢病、肾病、风湿病、传染病)] 10[医学] 

基　　金：宁夏自然科学基金项目(2023AAC03244) 

主　　题：乙肝病毒 急性肝衰竭 生物信息学 

摘      要：目的基于生物信息学综合分析,挖掘筛选乙型肝炎病毒感染相关性急性肝衰竭的差异表达基因,获得潜在治疗靶点和预后生物标志物。方法从基因表达综合数据库(GEO)中选取GSE14668、GSE38941、GSE62029和GSE96851数据集,采用R limma软件进行差异分析筛选差异表达基因,对差异表达基因进行GO功能注释、KEGG分析和GSEA通路富集分析,利用STRING数据库和Cytoscape软件构建蛋白互作网络(PPI),筛选出关键基因,用GEO数据库中GSE96851数据集进行验证,并应用受试者工作特征(ROC)曲线评估差异表达基因作为治疗和预后潜在生物标志物的价值。结果共筛选出1300个差异表达基因,其中724个上调,576个下调,通过Cytoscape的MCODE模块进行PPI分析得到APOB、ITGB2、CD8A、CD44、TYROBP、VEGFA、ITGAM、CD86、PTPRC和TLR410个关键基因。ROC曲线分析显示,上述10个关键基因作为治疗和预后潜在价值的曲线下面积(AUC)均大于0.9,灵敏度和特异度均在0.8以上,说明选取的10个关键基因均对乙型肝炎病毒感染相关性急性肝衰竭具有较高诊断价值。结论APOB、ITGB2、CD8A、CD44、TYROBP、VEGFA、ITGAM、CD86、PTPRC和TLR4基因是乙型肝炎病毒相关急性肝衰竭潜在的预后指标和治疗靶点。