禽源肠聚集性大肠埃希菌中多黏菌素耐药基因mcr-1流行分布及遗传特征

作     者：刘明香 张静 王姗 庄源 陈敏 丰俊 

作者机构：上海市虹口区疾病预防控制中心 上海市疾病预防控制中心 

出 版 物：《中国热带医学》 (China Tropical Medicine)

年 卷 期：2024年

学科分类：1004[医学-公共卫生与预防医学(可授医学、理学学位)] 100403[医学-营养与食品卫生学] 10[医学] 

基　　金：上海市加强公共卫生体系建设三年行动计划(2023-2025年)学科带头人项目(No.GWVI-11.2-XD28) 虹口区疾病预防控制中心人才培养项目(No.ZXRC-2022-03) 上海市虹口区卫生健康委员会医学科研课题立项建设项目(虹卫2402-25) 

主　　题：生禽肉 肠聚集性大肠埃希菌 多黏菌素耐药基因 药物敏感性 全基因组测序 

摘      要：目的 了解2023年2—11月上海市虹口区冷冻生禽肉中大肠埃希菌的污染状况及其携带多黏菌素mcr-1耐药基因的分布和遗传特征。方法 2023年2—11月在上海市虹口辖区的农贸市场、商店、饭店和网店等4类场所随机采集鸡、鸭、鸽子等3类生禽肉共100份进行致泻性大肠埃希菌的分离培养,应用微量肉汤稀释法进行药物敏感实验,采用实时荧光定量聚合酶链反应（polymerase chain reaction,PCR）检测mcr-1耐药基因,通过全基因组测序分析mcr-1阳性菌株的耐药基因、质粒类型、多位点序列分型（multilocus sequence typing,MLST）。分别基于单拷贝基因和最大似然法构建菌株核心基因组和MCR-1蛋白的系统进化树。借助IBM SPSS Statistics 25.0软件进行数据分析。结果 在100份生禽肉样本中,29份样品中检出致泻性大肠埃希菌且均为肠聚集性大肠埃希菌（enteroaggregative *** coli,EAEC）,总体检出率为29.0%（29/100）。采样地点中饭店检出率最高53.3%（8/15）。有2株（6.9%,2/29）鸡源EAEC携带mcr-1耐药基因,均为产超广谱β-内酰胺酶（extended-spectrum beta-lactamases,ESBLs）的多重耐药（multidrug resistant,MDR）菌,对环丙沙星、萘啶酸、氨苄西林、头孢噻肟、头孢唑林、四环素、庆大霉素和多黏菌素耐药率达到100.0%,此外还携带blaCTX-M-55、blaCTX-M-14、blaTEM-1、qnrS1、tet（A）、tet（M）、sul1、sul2、fosA3、aadA2、aac（3）-Ⅳa、aac（3）-Ⅱd、aph（4）-Ⅰa、mph（A）、mrx等多种耐药基因。MLST分析结果显示2株阳性菌的ST型分别属于ST69和ST156,携带mcr-1的质粒类型均为InCH12。2株禽源大肠埃希菌的核心基因组分析后发现分别与人源***＿042（GCA＿000027125）和***＿SE11（GCA＿000010385）亲缘类似。MCR-1蛋白与多国报道的禽源MCR-1蛋白亲缘较高。结论 上海市虹口区生禽肉中肠聚集性大肠埃希菌污染较为严重,且大多菌株具有MDR特性。建议需对冷冻生禽类具有公共卫生意义的耐药基因如mcr-1开展持续性分子监测,遏制耐药产生。