小麦全基因组NBS类R基因分析及2AL染色体NBS-SSR特异标记开发

作     者：乔麟轶 常建忠 郭慧娟 高建刚 郑军 畅志坚 QIAO Lin-Yi;CHANG Jian-Zhong;GUO Hui-Juan;GAO Jian-Gang;ZHENG Jun;CHANG Zhi-Jian

作者机构：山西大学生命科学学院山西太原030006 山西省农业科学院作物科学研究所/作物遗传与分子改良山西省重点实验室山西太原030031 山西省农业科学院旱地农业研究中心山西太原030031 北京市农林科学院杂交小麦工程技术研究中心北京100097 山西省农业科学院小麦研究所山西临汾041000 

出 版 物：《作物学报》 (Acta Agronomica Sinica)

年 卷 期：2016年第42卷第6期

页      面：795-802页

核心收录：

学科分类：09[农学] 0901[农学-作物学] 

基　　金：国家自然科学基金项目(31171839,31401385) 山西省青年基金项目(2015021145) 山西省农业攻关项目(20150311001-1,20150311001-5) 山西省农业科学院攻关项目(15YGG01) 北京市农林科学院青年基金项目(QNJJ201428)资助 

主　　题：小麦 抗病 NBS类基因 SSR标记 2AL染色体 

摘      要：NBS（nucleotide binding site）类基因是植物界中最重要的一类抗病基因。用信息学方法从普通小麦（Triticum aestivum L.）全基因组中分离出2406条含有NBS结构的完整蛋白序列,每条包含48~2272个氨基酸残基。根据NBS结构域两端是否连接CC或LRR结构域,将TaNBS分为N、CN、NL和CNL 4类。对TaNBS所在scaffold序列的SSR位点进行诊断,从1203条scaffold序列上发现2177个SSR位点,以二碱基重复位点最多,占73.5%。针对小麦2AL染色体上的51个SSR位点开发标记,缺体–四体和双端体验证结果表明,有39个标记（76.5%）为2AL特异标记,其中24个特异标记在抗白粉病材料Khapli（2AL上携带Pm4a）和感病材料Chancellor间存在多态性。利用近等基因系Khapli/8＊Cc筛选出3个可能与Pm4a连锁的NBS-SSR标记,分别是Sxaas_2AL22、Sxaas_2AL39和Sxaas_2AL46。本研究开发的与抗病序列紧密连锁的特异SSR标记可用于2AL染色体上抗病新基因的检测以及已有抗病基因的候选序列筛选。