申克孢子丝菌双相转换差异表达基因的生物信息学分析
Bioinformatics of Differentially Expressed Genes Related to Dimorphic Transition of Sporothrix schenckii作者机构:重庆医科大学附属第一医院皮肤科重庆400016 重庆医科大学基础医学院基础医学实验教学中心病原生物学教研室 重庆医科大学神经科学研究中心重庆400016 重庆医科大学附属儿童医院皮肤科重庆400014
出 版 物:《中国生物制品学杂志》 (Chinese Journal of Biologicals)
年 卷 期:2011年第24卷第9期
页 面:1022-1027页
核心收录:
学科分类:1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学]
主 题:申克孢子丝菌 抑制性消减杂交 基因文库 生物信息学分析
摘 要:目的探讨申克孢子丝菌菌丝相(Mycelium,M)和酵母相(Yeast,Y)双相转换的分子机制,筛选与其双相转换相关的差异表达基因。方法应用抑制性消减杂交技术,构建申克孢子丝菌菌丝相和酵母相的正反cDNA消减文库,并对其差异表达的基因进行生物信息学分析。结果 M+Y文库获得751条表达序列标签(Expressed sequence tags,ESTs),经拼接后获得101条非冗余序列(Unigenes);Y+M文库获得875条ESTs,拼接获得249条Unigenes。申克孢子丝菌酵母相和菌丝相的转换伴随着不同菌相细胞差异基因的高表达,这些高表达的差异基因可分为结构基因类、代谢酶类、细胞表面分子类及功能不明的细胞分子。结论 已成功构建申克孢子丝菌双相转换相关的cDNA消减文库,并筛选出部分差异表达基因,为进一步研究申克孢子丝菌致病相关基因奠定了基础。