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基于化合物库测试的gSpan算法

The gSpan Algorithm Based on Compound-Library Testing

作     者:许荣斌 谢莹 吴建国 XU Rong-bin;XIE Ying;WU Jian-guo

作者机构:安徽大学计算智能与信号处理教育部重点实验室安徽合肥230039 

出 版 物:《计算机技术与发展》 (Computer Technology and Development)

年 卷 期:2007年第17卷第10期

页      面:58-60,64页

学科分类:08[工学] 0835[工学-软件工程] 081202[工学-计算机软件与理论] 0812[工学-计算机科学与技术(可授工学、理学学位)] 

基  金:国家科委创新基金资助项目(06C26213401229) 

主  题:gSpan 化合物库 频繁子图 深度优先搜索 

摘      要:gSpan算法是一种基于频繁图的数据挖掘算法。该算法基于无候选人产生的频繁子图,采用深度优先搜索策略挖掘频繁连接子图。由于其设计结构具有连续性以及无候选人产生,算法的性能得以提高,在执行速度上可以达到前人算法如FSG算法的15~100倍。基于化合物库Chemical_340测试发现,该算法能够以卓越性能有效挖掘频繁子图。该算法可以应用在搜索具有相同子结构的化合物研究中,对相关领域研究发展具有重要意义。

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