镇坪乌鸡群体遗传多样性及遗传结构分析

作     者：任远明 梁小军 敖显配 张睿昕 邓必俊 杨丽煜 朱瑞 魏泽辉 

作者机构：陕西省安康市镇坪县畜牧兽医中心 陕西省安康市畜牧兽医中心 西北农林科技大学 

出 版 物：《中国家禽》 (China Poultry)

年 卷 期：2024年第10期

页      面：179-184页

学科分类：0905[农学-畜牧学] 09[农学] 090501[农学-动物遗传育种与繁殖] 

基　　金：陕西省科技创新驱动—镇坪乌鸡选育与开发利用项目(2022.29) 陕西省重点研发计划项目(2024NC-YBSM-083) 

主　　题：镇坪乌鸡 全基因组重测序 遗传结构 遗传多样性 遗传资源保护 

摘      要：为了解镇坪乌鸡的群体遗传多样性和遗传结构差异，试验对镇坪乌鸡及国内外9个品种鸡（略阳乌鸡、红色原鸡、白来航鸡、BRB肉鸡、赤水乌骨鸡、乌蒙乌骨鸡、北京油鸡、丝羽乌骨鸡和藏黑鸡）的基因组测序数据进行分析，利用基因组核苷酸多态性信息计算观测杂合度和连锁不平衡衰减距离等评价群体遗传多样性的指标，并通过构建系统发育树，进行群体遗传分化指数（Fst）、主成分和Admixture分析解析这些品种的群体结构特征。结果显示：镇坪乌鸡遗传多样性丰富、杂合度较低，连锁不平衡（LD）衰减距离短，衰减速度快；Fst分析结果表明，不同乌鸡品种之间呈现较低水平的遗传分化，而镇坪乌鸡与非乌鸡品种之间呈现中高水平的遗传分化；Admixture分析显示，国外品种遗传结构单一，国内地方品种则遗传结构相对复杂，且可能与国外品种发生过杂交；此外，略阳乌鸡与镇坪乌鸡的遗传结构相似，表明两个品种可能具有较高的同源性。综上所述，镇坪乌鸡遗传多样性丰富，遗传资源具有巨大的挖掘潜力，但杂合度较低，存在与其他品种杂交的现象，应及时建立和实施遗传资源保护策略。