病原体靶向测序技术在疑似肺部感染患者中的应用价值分析

作     者：张彩霞 叶黎文 黄春艳 

作者机构：江汉大学附属湖北省第三人民医院呼吸与危重症医学科 

出 版 物：《解放军医学杂志》 (Medical Journal of Chinese People's Liberation Army)

年 卷 期：2024年第09期

页      面：1022-1028页

核心收录：

学科分类：1002[医学-临床医学] 1010[医学-医学技术（可授医学、理学学位）] 100201[医学-内科学(含：心血管病、血液病、呼吸系病、消化系病、内分泌与代谢病、肾病、风湿病、传染病)] 10[医学] 

主　　题：病原体靶向测序 常规病原学检测 肺部感染 支气管肺泡灌洗液 应用价值 

摘      要：目的 探讨病原体靶向测序(tNGS)技术在疑似肺部感染患者中的应用价值。方法 回顾性分析2021年1月-2023年7月湖北省第三人民医院呼吸与危重症医学科收治的80例疑似肺部感染患者的临床资料，所有患者均行支气管肺泡灌洗液(BALF)tNGS及常规病原学检测。分析患者人口学特征，比较t NGS与常规方法检测的病原体分布结果，并比较确诊肺部单一感染者与混合感染者的临床资料。结果 80例中，74例确诊感染。大部分感染者存在基础疾病，以慢性心脏疾病(42.5%)、慢性呼吸系统疾病(35.0%)和糖尿病(20.0%)为主。t NGS检测结果致35例患者(43.8%)的治疗策略改变。共检出45种病原体，其中tNGS检出病原体169株，常规方法检出病原体63株；两者联合检测出的病原体以细菌较多。tNGS检出的病原体株数排序：细菌病毒真菌非典型病原体人结核分枝杆菌。常规方法检出的病原体株数排序：真菌病毒细菌非典型病原体人结核分枝杆菌。两种方法检测结果的一致性较差(Kappa值0.172,P=0.020)。t NGS检出病原菌阳性比例及在细菌、病毒、非典型病原体的阳性检出率均明显高于常规方法(P0.05)。以临床诊断为金标准，tNGS检测的敏感度明显高于常规方法(P=0.026)，而两者特异度比较差异无统计学意义(P0.05)。在74例确诊肺部感染者中，6例无明确的病原体，单一感染者23例，混合感染者45例。在混合感染者中，常见的组合是细菌-病毒混合感染(12/45,26.7%)。混合感染者的病死率和住院天数均明显高于或长于单一感染者(P0.05)。结论 tNGS技术较常规方法的病原体检测敏感度高，尤其对细菌、病毒、非典型病原体及少见病原体更为敏感。此技术有利于识别混合感染，可作为临床常规病原学检测方法的补充。