秋茄KoWRKY43基因克隆、表达与生物信息学分析

作     者：蒋文骏 舒红锁 陈正满 任典挺 杨党 田荣江 杜照奎 JIANG Wenjun;SHU Hongsuo;CHEN Zhengman;REN Dianting;YANG Dang;TIAN Rongjiang;DU Zhaokui

作者机构：台州学院生命科学学院浙江台州318000 三门县自然资源和规划局浙江三门317100 台州循环经济发展有限公司浙江台州318000 台州学院浙江省植物进化生态学与保护重点实验室浙江台州318000 

出 版 物：《浙江农业学报》 (Acta Agriculturae Zhejiangensis)

年 卷 期：2024年第36卷第8期

页      面：1832-1843页

学科分类：07[理学] 0713[理学-生态学] 

基　　金：台州市科技计划(22nya05) 浙江省自然资源厅科技项目(2021-43) 浙江省基础公益研究计划(GN21C160013) 

主　　题：秋茄 KoWRKY43基因 生物信息学分析 基因克隆 激素 

摘      要：转录因子WRKY在开花植物中广泛存在,参与并调节植物的生长发育与防御反应等。为探究红树植物秋茄WRKY基因在非生物胁迫过程中的作用,以秋茄幼苗为试验材料,提取叶片总RNA,通过反转录PCR(RT-PCR)技术克隆获得KoWRKY43基因(GenBank登录号OR789874),采用生物信息学手段分析其基因序列和蛋白质结构特点,利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术研究其表达模式。结果表明,KoWRKY43基因开放阅读框(ORF)为942 bp,编码313个氨基酸,蛋白质分子式为C_(1484)H_(2415)N_(439)O_(459)S_(14),分子量为34.2 ku,理论等电点为9.74,无信号肽,无跨膜结构,定位于细胞核,与木薯、银白杨和簸箕柳亲缘关系相对较近。qPCR检测显示,KoWRKY43基因在秋茄根中表达量最大,显著高于茎、叶、花和果实;幼叶KoWRKY43的表达量受NaCl诱导持续上升,在24 h表达量最大;激素水杨酸和脱落酸的诱导使其表达量先升高后降低,在6 h达到峰值;茉莉酸甲酯在24 h内均未显著改变其表达水平。研究结果为后续开展KoWRKY43基因的功能研究和培育抗逆秋茄品种提供了理论基础。