鸽F3卵泡转录组构建及卵泡闭锁相关基因分析

作     者：王莹 陈静 苗冬枝 张弛 陈俊红 杨海明 王志跃 WANG Ying;CHEN Jing;MIAO Dongzhi;ZHANG Chi;CHEN Junhong;YANG Haiming;WANG Zhiyue

作者机构：扬州大学动物科学与技术学院扬州225009 金陵科技学院动物科学与食品工程学院南京210000 

出 版 物：《中国畜牧兽医》 (China Animal Husbandry & Veterinary Medicine)

年 卷 期：2024年第51卷第9期

页      面：3921-3929页

学科分类：0905[农学-畜牧学] 08[工学] 09[农学] 0836[工学-生物工程] 090501[农学-动物遗传育种与繁殖] 

基　　金：国家自然科学基金(32372875) 江苏高校优势学科建设工程四期项目(PAPD) 

主　　题：鸽 产蛋间隔 颗粒细胞 卵泡闭锁 转录组 

摘      要：【目的】通过对鸽F3卵泡颗粒细胞进行高通量测序筛选出与卵泡闭锁相关的关键基因。【方法】选择产蛋间隔第5(LI5)和7(LI7)天的白羽王鸽各3只,构建F3卵泡颗粒细胞转录文库,利用转录组测序筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并对DEGs进行功能注释,利用实时荧光定量PCR对随机选择的5个DEGs进行表达量验证。【结果】LI5和LI7期鸽F3卵泡颗粒细胞的6个cDNA文库中获得41.96~43.62 Mb clean reads,Q3092%,比对率为82.21%~85.94%。筛选出LI5和LI7期F3卵泡颗粒细胞DEGs共6587个,其中2318个基因上调,4269个基因下调。GO功能富集分析显示,DEGs主要富集在细胞过程、代谢过程、连接和催化活性功能等条目。KEGG通路富集分析显示,DEGs主要显著富集到聚焦黏附、内质网加工蛋白、卵巢类固醇合成和类固醇激素生物合成等信号通路。结合蛋白-蛋白互作网络和关键通路的DGEs发现,StAR、HSD 3 B_(1)、MARCH 6、BCL 2、BOK、CDCA 7等基因在鸽卵泡闭锁中发挥了重要作用。实时荧光定量PCR结果显示,5个基因在LI5和LI7期鸽F3卵泡颗粒细胞中表达变化趋势与转录组测序结果一致。【结论】试验获得的6个差异表达基因(StAR、HSD3B1、MARCH6、BCL2、BOK、CDCA7)在鸽卵泡闭锁中发挥重要作用,为进一步了解鸽卵泡闭锁的分子机制提供依据,并为抑制鸽卵泡闭锁、提高鸽产蛋量提供理论基础。