微滴式数字PCR技术快速精准检测苹果牛眼果腐病原多年明孢盘菌

作     者：李辉 姜锋 杨春光 姜丽 赵鹏 李鑫 LI Hui;JIANG Feng;YANG Chunguang;JIANG Li;ZHAO Peng;LI Xin

作者机构：大连海关技术中心辽宁大连116000 东港海关综合技术服务中心辽宁丹东118300 长春工业大学人文信息学院吉林长春130122 中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室北京100101 

出 版 物：《菌物学报》 (Mycosystema)

年 卷 期：2024年第43卷第9期

页      面：67-79页

核心收录：

学科分类：09[农学] 0904[农学-植物保护] 

基　　金：“十四五”国家重点研发计划(2021YFD1400100) 

主　　题：微滴式数字PCR 苹果牛眼果腐病 多年明孢盘菌 快速检测 

摘      要：为了建立苹果牛眼果腐病原多年明孢盘菌Neofabraea perennans微滴式数字PCR (ddPCR)检测方法,实现苹果检疫性病原菌的高效率、高精度的检疫鉴定和疫情监控,为口岸外来有害生物防控和保护我国生态安全提供技术服务和支持。本研究以***为研究对象,通过生物信息学分析确定β-微管蛋白基因(TUB2)作为靶标进行特异性引物与探针设计,通过引物和探针浓度以及退火温度的优化,构建***的ddPCR特异性检测体系。研究结果表明,***的ddPCR检测体系的绝对定量检测低限为0.16 copies/μL,最低基因组DNA检测浓度为10.0 pg/μL,与qPCR方法一致,在定量检测范围内的线性相关系数R2大于0.999,RSD小于25%,说明该检测体系的重复性较好,能够用于进口水果样品中苹果牛眼果腐病原多年明孢盘菌***的快速精准检测。