薏苡ClSAD、ClFAD2基因单倍型鉴定与相关脂肪酸关联分析

作     者：尚昆 付瑜华 李秀诗 蒙秋伊 杨玲玲 朱加保 

作者机构：贵州省农业科学院贵州省亚热带作物研究所 安徽省农业科学院棉花研究所 

出 版 物：《植物遗传资源学报》 (Journal of Plant Genetic Resources)

年 卷 期：2024年

核心收录：

学科分类：09[农学] 0901[农学-作物学] 

基　　金：国家自然科学基金(32360480) 贵州省农业科学院国基后补助项目(黔农科院国基后补助24,黔农科院国基后补助58) 贵州省农业科学院种质资源项目(黔农科种质资源008) 贵州省农业科学院青年科技基金项目(黔农科院青年科技基金06) 

主　　题：薏苡 脂肪酸 单倍型 硬脂酸脱饱和酶SAD基因 油酸脱饱和酶FAD2基因 

摘      要：薏苡仁油是薏苡仁主要功能性物质之一，脂肪酸是其重要组成部分。以中国9个省份的190份薏苡种质为材料，检测其种仁硬脂酸、油酸、亚油酸含量，分析ClSAD、ClFAD2基因序列多态性并鉴定单倍型，进行脂肪酸含量单倍型关联分析。结果表明，不同薏苡种质种仁3种脂肪酸含量存在广泛变异，变异系数为15.84% ～ 23.05%，遗传多样性指数为5.22 ～ 5.23，其中油酸含量最高，硬脂酸含量最低，各脂肪酸组分间呈极显著正相关。ClSAD和ClFAD2内部各有14个和3个SNP，分别鉴定到5个单倍型组合，ClSAD基因单倍型Hap3和ClFAD2基因单倍型Hap1分别与参考基因组一致。ClSAD基因单倍型Hap3与硬脂酸含量显著关联且具有负效应，利于硬脂酸向油酸转化，ClFAD2基因单倍型Hap1利于亚油酸的积累，而Hap2与亚油酸酸含量显著关联且具有负效应，不利于亚油酸的合成。在2个基因内部各鉴定到1个关键SNP位点，分别是形成SAD和FAD2酶活性差异的关键。研究结果将为高油薏苡优良品种的选育、分子标记开发和相关分子机制解析提供理论基础。