青天葵NfCCD8基因的克隆、生物信息学分析及生物特性

作     者：刘舒璇 池珈仪 詹若挺 何瑞 

作者机构：广州中医药大学中药资源科学与工程研究中心 广州中医药大学岭南中药资源教育部重点实验室 广州中医药大学中药学院 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2024年

学科分类：1008[医学-中药学(可授医学、理学学位)] 10[医学] 

基　　金：广东省乡村振兴战略专项—农业科技发展及资源环境保护管理项目—广东省现代南药产业技术体系创新团队基金(2023KJ148)资助 

主　　题：青天葵 NfCCD8 生物信息学分析 表达模式分析 亚细胞定位 

摘      要：CCD8蛋白是独脚金内酯(SLs)合成途径的关键酶，能将9-cis-β-apo-10’-carotenal转化成SLs的前体物质，进而生成活性独脚金内酯发挥调控植物分枝的作用。本研究通过本地BLAST筛选获得一条编码CCD8蛋白的Cluster序列，命名为NfCCD8，该基因全长1 705 bp，编码区(CDS)长1 662 bp，编码553个氨基酸，蛋白分子质量为61.00 kD。生物信息学预测分析表明该蛋白理论等电点为6.04，不稳定系数为46.65，脂肪系数为84.5，总平均亲水性为-0.246，是亲水性蛋白。其含有一个保守的RPE65结构域，无信号肽及明显跨膜域。此外，NfCCD8蛋白的二级结构主要是无规则卷曲，三级结构与AtCCD8相似，两者的均方根偏差值为0.383。系统进化树分析表明NfCCD8与桃红蝴蝶兰聚为一支。RT-qPCR分析发现NfCCD8在青天葵球茎中表达量最高。瞬时表达实验显示NfCCD8蛋白位于内质网，不同于其他物种CCD8蛋白的定位结果。本研究为进一步了解NfCCD8 调控分枝的机制奠定了基础，并为解决青天葵的资源短缺问题提供了思路。