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威宁短柱油茶低温应答CwWRKY65基因的克隆及生物信息学分析

作     者:徐红云 徐子敬 

作者机构:贵州民族大学生态环境工程学院 

出 版 物:《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期:2024年

学科分类:0907[农学-林学] 08[工学] 0829[工学-林业工程] 09[农学] 

基  金:贵州省科技计划项目(黔科合基础-ZK〔2022〕一般210) 贵州省教育厅青年科技人才成长项目(黔教合KY字〔2021〕106)共同资助 

主  题:威宁短柱油茶 WRKY 基因克隆 生物信息学 

摘      要:威宁短柱油茶(Camellia weiningensis)为贵州西南喀斯特高寒山区特有、抗寒性强且经济性状优良的油茶物种。WRKY转录因子在植物响应非生物胁迫中发挥重要的调控作用,但对威宁短柱油茶WRKY转录因子参与低温调控的研究尚未开展。本研究通过转录组学数据筛选低温应答WRKY转录因子,利用PCR技术克隆了CwWRKY65基因cDNA全长序列,并通过生物信息学方法对序列进行结构及功能预测。结果表明,威宁短柱油茶CwWRKY65基因在4 ℃和-4 ℃低温条件下均显著上调表达;该基因包含一个813 bp的开放读码框,编码270个氨基酸,以丝氨酸Ser含量最高,为11.5%;该蛋白包含一个WRKY保守结构域和一个C2H2锌指结构,是无跨膜结构的亲水性蛋白;α-螺旋和无规则卷曲是CwWRKY65蛋白二级结构的主要成分,分别占比17.04%和71.48%;系统进化分析显示该蛋白与茶树(C. sinensis)的WRKY65亲缘关系最近。本研究为未来深入研究威宁短柱油茶CwWRKY65基因的分子生物学功能奠定了理论基础,并为未来油茶的抗寒遗传育种提供了依据。

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