重庆地区辣椒疫霉生理小种组成和群体遗传多样性分析

作     者：张世才 张基林 段敏杰 杨小苗 黄启中 黄任中 李怡斐 罗云米 ZHANG Shicai;ZHANG Jilin;DUAN Minjie;YANG Xiaomiao;HUANG Qizhong;HUANG Renzhong;LI Yifei;LUO Yunmi

作者机构：重庆市农业科学院蔬菜花卉研究所重庆401329 重庆师范大学生命科学学院重庆401331 

出 版 物：《植物病理学报》 (Acta Phytopathologica Sinica)

年 卷 期：2024年第54卷第4期

页      面：687-701页

核心收录：

学科分类：09[农学] 0904[农学-植物保护] 090401[农学-植物病理学] 090402[农学-农业昆虫与害虫防治] 

基　　金：国家特色蔬菜产业技术体系(CARS-24-A-04) 川渝联合实施重点研发项目(cstc2021jscx-cylhX0002) 重庆市人民政府与中国农业科学院农业科技创新战略合作项目(渝农发2022-164号) 

主　　题：辣椒疫霉 生理小种 遗传多样性 群体结构 

摘      要：本研究采用平板对峙培养、鉴别寄主灌根接种和微卫星分子标记等方法,对2019和2020年采集自重庆市的66株辣椒疫霉(Phytophthora capsici)进行交配型、生理小种组成和群体遗传多样性分析。交配型检测结果显示A1交配型有13株,A2交配型有53株。生理小种鉴定结果显示42株***中有11株race1、28株race2、1株race3和2株race6(超级毒性小种)。利用6个已报道的微卫星分子标记位点对所有***菌株进行群体变异分析,共计获得59个不同的基因型;来自重庆地区11个***地理群体的有效等位基因数Ne为1.786~2.881,期望杂合度He为0.352~0.577,Shannon-Wiener指数H为1.242~2.079,多态标记百分率为83.33%~100%,群体之间的基因交流频繁(Nm=0.133~7.680),总群体的遗传分化处于中等水平(F_(ST)=0.113)。以上结果表明***在重庆各区县的遗传变异程度不同,总群体内杂合子过剩,具有丰富的遗传多样性。各地理群体的交配型组成、固定系数以及Hardy-Weinberg平衡和连锁不平衡检验提示重庆地区***可能同时存在无性和有性繁殖。AMOVA分析结果显示遗传变异主要来自群体内部。主成分分析(DAPC)表明重庆地区***菌株间存在明显差异,可划分为2个类群。Structure分析显示重庆地区***可能来自两个不同的祖先群体。上述有关重庆地区***有性生殖、生理小种组成和群体遗传结构等方面的研究结果为该地区辣椒疫病的防控奠定了基础。