基于生物信息学方法分析L1CAM在肺鳞状细胞癌中的表达及意义

作     者：宋如昕 庞鑫 霍振宇 任飞 任晨霞 SONG Ruxin;PANG Xin;HUO Zhenyu;REN Fei;REN Chenxia

作者机构：长治医学院中心实验室山西长治046000 

出 版 物：《长治医学院学报》 (Journal of Changzhi Medical College)

年 卷 期：2024年第38卷第4期

页      面：243-248页

学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

主　　题：肺鳞状细胞癌 细胞黏附分子Ll 生物信息学分析 

摘      要：目的:分析细胞黏附分子Ll基因(L1CAM)在肺鳞状细胞癌中的表达,并探讨其潜在的生物学意义。方法:利用Ualcan数据库分析肺鳞状细胞癌(LUSC)肿瘤组织及正常组织L1CAM表达,并在正常细胞系和肿瘤细胞系中进行实时荧光定量PCR(qPCR)验证;采用Sangerbox3.0分析L1CAM表达与LUSC患者预后的关系;通过LinkedOmics检索L1CAM共表达基因,将获取的基因集进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析;利用STRING数据库构建蛋白相互作用(PPI)网络。结果:与正常肺组织比较,LUSC组织中L1CAM表达水平明显升高;经qPCR实验验证,与正常肺上皮细胞相比,LUSC细胞系中的L1CAM表达量显著升高;L1CAM共表达基因主要富集的生物学过程包括细胞发育、细胞或亚细胞成分的运动、细胞内信号转导等;主要富集的细胞组分包括细胞外基质、内质网腔、线粒体膜等;主要参与的生物学功能包括信号受体结合、钙离子结合、细胞外基质结构成分等;KEGG信号通路主要与黏着斑、ECM受体互作、顺铂耐药性等相关;L1CAM高表达患者的总生存期(OS)、疾病特异性生存期(DSS)、无病间期(DFI)、无进展间期(PFI)明显低于低表达患者,预示高表达L1CAM的不良预后;PPI网络显示L1CAM蛋白与EGFR、NCAM1、ANK1-3等存在互作关系。结论:L1CAM在LUSC组织中高表达,可作为预后指标;该基因的表达参与多种生物学功能,因此有望成为肺鳞癌潜在的生物标志物。