大黄鱼氧依赖信号通路关键基因的鉴定与表达分析
Characterization and Expression Analysis of Key Genes of the Oxygen-Dependent Signaling Pathway in Larimichthys crocea作者机构:浙江海洋大学国家海洋设施养殖工程技术研究中心浙江舟山316022
出 版 物:《浙江海洋大学学报(自然科学版)》 (Journal of Zhejiang Ocean University:Natural Science)
年 卷 期:2024年第43卷第3期
页 面:193-206页
学科分类:0710[理学-生物学] 07[理学] 071002[理学-动物学]
基 金:浙江省重大科技专项(2020C02004) 南麂列岛国家海洋自然保护区管理局与浙江海洋大学合作项目(NJKJ2023002)
摘 要:鉴定了大黄鱼EGLN家族的EGLN1、EGLN2、EGLN3和HIF1α基因。发现这4个基因所编码的蛋白都是膜外蛋白,没有跨膜区。P4Hc的结构域为EGLN家族的特征结构域。多序列比对发现了这4个基因的保守性。蛋白—蛋白相互作用(PPI)网络分析发现,整个EGLN家族与HIF1α、VHL、TCEB1和EPAS1直接相互作用。系统发育分析验证了EGLN1在耐受低氧中起关键作用。实时荧光定量PCR分析显示这4个基因在所有组织中表达。在缺氧胁迫下,除了鳃和脑组织,EGLN1的表达先下调再上调。这些结果为大黄鱼养殖生物学提供了基础资料。