广西马流感病毒(A/Equine/Guangxi/1/09)NA基因的克隆与序列分析

作     者：韦建华 何奇松 冯淑萍 熊毅 胡丽萍 颜健华 WEI Jian-hua;HE Qi-song;FENG Shu-ping;XIONG Yi;HU Li-ping;YAN Jian-hua

作者机构：河池市动物疫病预防控制中心广西河池547000 广西动物疫病预防控制中心南宁530001 

出 版 物：《南方农业学报》 (Journal of Southern Agriculture)

年 卷 期：2015年第46卷第5期

页      面：895-899页

学科分类：090603[农学-临床兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学] 

基　　金：河池市科学研究与技术开发计划项目(河科攻1430-3) 

主　　题：马流感病毒 NA基因 克隆 序列分析 

摘      要：【目的】了解广西马流感病毒（Equine influenza virus,EIV）的分子流行病学特征并揭示其遗传变化规律,为其疫苗候选毒株的筛选及有效防控马流感疫情奠定基础。【方法】采用RT-PCR对广西EIV分离株（A/Equine/Guangxi/1/09,简称GX09株）进行NA基因扩增,经克隆测序及序列比对分析,绘制遗传进化树。【结果】GX09株NA基因全长1420 bp,其开放阅读框（ORF）为1413 bp,编码470个氨基酸,包含7个糖基化位点及17个半胱氨酸（Cys）残基。GX09株与参考毒株的NA基因核苷酸同源性为74.7%~99.5%,其推导氨基酸同源性为80.4%~99.4%;与Gansu08株、Heilongjiang08株、Inner mongolia08株及Liaoning08株的核苷酸及其推导氨基酸同源性最高,分别为99.5%和99.4%;与1989年在我国吉林分离获得毒株（Jilin89）的同源性最低,对应的核苷酸及其推导氨基酸同源性分别为74.7%和80.4%。从遗传进化树可以看出,GX09株与最近几年国内外分离获得的毒株亲缘关系较近,且同属于美洲型分支。【结论】目前广西流行的EIV与国内外的流行毒株一致。