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生物信息学在基因芯片中的应用

APPLICATION OF BIOINFORMATICS TO GENE CHIP

作     者:孙啸 王晔 何农跃 赵雨杰 陆祖宏 SUN Xiao, WANG Ye, HE Nong-yao, ZHAO Yu-jie, LU Zu-hong(Lab. of Molecular and Biomolecular Electronics, Southeast University, Nanjing, 210096, China)

作者机构:东南大学分子与生物分子电子学实验室江苏南京210096 

出 版 物:《生物物理学报》 (Acta Biophysica Sinica)

年 卷 期:2001年第17卷第1期

页      面:27-34页

核心收录:

学科分类:0710[理学-生物学] 0711[理学-系统科学] 071010[理学-生物化学与分子生物学] 07[理学] 

基  金:国家自然科学基金!资助项目 (69971010) 

主  题:生物信息学 基因芯片 DNA阵列 探针设计 

摘      要:生物信息学和基因芯片是生命科学研究领域中的两种新方法和新技术 ,生物信息学与基因芯片密切相关 ,生物信息学促进了基因芯片的研究与应用 ,而基因芯片则丰富了生物信息学的研究内容。本论文探讨生物信息学在基因芯片中的应用 ,将生物信息学方法运用到高密度基因芯片设计和芯片实验数据管理及分析。从信息学的角度提出基因芯片设计准则 ,提出寡核苷酸探针的优化设计方法 ,将该方法运用于再测序型芯片和基因表达型芯片的设计 ,在此基础上研制出高密度基因芯片设计软件系统和实验结果分析系统。

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