基于rDNA ITS序列的何首乌PCR-RFLP分子鉴别
Molecular Identification of Fallopia multiflora by PCR-RFLP Based on rDNA ITS Sequence作者机构:华南理工大学生物科学与工程学院广东广州510006 广州军区广州总医院广东广州510010
出 版 物:《华南理工大学学报(自然科学版)》 (Journal of South China University of Technology(Natural Science Edition))
年 卷 期:2009年第37卷第6期
页 面:74-78,83页
核心收录:
学科分类:0810[工学-信息与通信工程] 1006[医学-中西医结合] 0805[工学-材料科学与工程(可授工学、理学学位)] 10[医学] 100602[医学-中西医结合临床] 0812[工学-计算机科学与技术(可授工学、理学学位)]
主 题:何首乌 分子鉴别 核糖体DNA内转录间隔区 PCR—RFLP
摘 要:对何首乌及其常见混淆品的核糖体DNA内转录间隔区(rDNAITS)序列进行了测序分析.结果表明:何首乌与其混淆品毛脉蓼、翼蓼及耳叶牛皮消ITSI区的差异率分别为6.91%、18.10%和42.20%,ITS2区的差异率分别为10.00%、19.40%和43.90%;而何首乌种内各居群间ITS1和ITS2区的差异率分别为0.00%~2.13%和0.00%~1.03%.基于何首乌及其混淆品的rDNAITS序列的差异,找出一个位于ITS2间隔区的何首乌特征性M6I酶切位点,用M6I酶对何首乌rDNAITS序列扩增产物酶切后得到含约531bp和109bp的两片段的聚合酶链反应一限制性片段长度多态性(PCR—RFLP)图谱,而其混淆品的rDNAITS序列扩增产物不能被NsbI酶切,故图谱呈单一条带.利用建立的PCR.RFLP方法可以很好地区分何首乌及其混淆品.