鸡8个功能基因5′-侧翼区与内含子的SNP多样性比较

作     者：饶友生 聂庆华 梁勇 杜颖军 阎文龙 张细权 Yousheng Rao;Qinghua Nie;Yong Liang;Yingjun Du;Wenlong Yan;Xiquan Zhang

作者机构：华南农业大学动物科学学院 江西教育学院生物技术研究所南昌330029 

出 版 物：《生物多样性》 (Biodiversity Science)

年 卷 期：2007年第15卷第4期

页      面：432-436页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 0905[农学-畜牧学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 090501[农学-动物遗传育种与繁殖] 

基　　金：国家重点基础研究发展规划(973计划)项目(编号2006CB102100) 

主　　题：鸡 5′-侧翼区 SNP 适应性 

摘      要：本研究旨在探讨鸡功能基因5′-侧翼区的单核苷酸多态性(SNP)水平。作者以白来航鸡、隐性白洛克鸡、杏花鸡、丝羽乌骨鸡、固始鸡、红色原鸡为材料,扩增了GH、DDBC1、RIKEN、RASGRP3、IGF1、THRSP、VIP及PRL共8个基因的5′-侧翼区DNA序列。扩增序列全长为8,399bp,SNP的总数为161个,平均每52bp出现一个SNP。8个功能基因5′-侧翼区核苷酸多样性的θ均值和π均值分别为0.00620±0.00110和0.00559±0.00100。比较检验表明,5′-侧翼区的SNP多样性显著低于内含子区域。5′-侧翼区是基因表达的一个重要调控区域,在分子进化和系统发生过程中承受着比内含子区域更大的选择压,其较低的SNP多样性是适应性较好的表现。Tajima检验与Fu和Li检验表明,与鸡繁殖性状显著关联的VIP基因和PRL基因很可能是人工选择或自然选择的目的基因。