狐貉源犬瘟热病毒融合蛋白基因的同源性分析

作     者：张莉 华育平 曾祥伟 刘澜澜 Zhang Li;Hua Yuping;Zeng Xiangwei;Liu Lanlan

作者机构：东北林业大学哈尔滨150040 

出 版 物：《东北林业大学学报》 (Journal of Northeast Forestry University)

年 卷 期：2008年第36卷第3期

页      面：70-72,77页

核心收录：

学科分类：090603[农学-临床兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学] 

基　　金：国家林业局动物保护项目(020413253) 黑龙江省科技攻关项目(GB02B506) 黑龙江省青年科技专项(QC07C33) 黑龙江省博士后基金(LBH-Z06153)资助 

主　　题：犬瘟热病毒 F基因 基因克隆 同源性分析 

摘      要：2004—2006年,从黑龙江省和内蒙等地发病饲养狐、貉中分离获得6株犬瘟热病毒(CDV),分别命名为MS01、SC01、ZD01、GN01、HL01、NM01分离株。根据Genbank上发表的的CDV F基因序列设计了1对特异性引物,应用RT-PCR方法分别对6个分离株F基因进行克隆、测序,并推导其氨基酸序列,绘制出F基因的遗传进化树。结果表明:6个CDV分离株F基因的开放阅读框架(ORF)均为1 989 bp,编码663个氨基酸,蛋白结构中的13个Cys残基位点和4个潜在的糖基化位点均高度保守,其裂解位点的氨基酸序列为220R-R-Q-R-224R。遗传进化分析表明:6个分离株与CDV代表强毒株A75/17属于同一谱系,均为强毒株。其中,HL01株与海豹瘟热病毒2型(PDV-2)亲缘关系较近,与其它5个分离株关系相对较远。