黄土高原地区大豆根瘤菌的遗传多样性和系统发育
Genetic diversity and phylogeny of soybean rhizobia isolated from the regions of Loess Plateau in China作者机构:中国农业科学院农业资源与农业区划研究所北京100081
出 版 物:《微生物学报》 (Acta Microbiologica Sinica)
年 卷 期:2010年第50卷第11期
页 面:1466-1473页
核心收录:
基 金:现代农业产业技术体系建设专项资助项目(nycytx-004) 中央级公益性科研院所科研业务费专项资助项目(2010-34)~~
主 题:大豆根瘤菌 BOX-PCR 16S rDNA PCR-RFLP 16S-23S rDNA IGS PCR-RFLP 遗传多样性 系统发育
摘 要:【目的】研究黄土高原地区大豆根瘤菌的遗传多样性和系统发育。【方法】采用BOX-PCR、16S rDNAPCR-RFLP、16S-23S IGS PCR-RFLP和16S rRNA基因序列分析方法对分离自我国黄土高原地区4个省的15个地区的130株大豆根瘤菌及部分参比菌株进行了遗传多样性和系统发育分析。【结果】BOX-PCR反映的菌株多样性最丰富,形成的遗传群最多,16S rDNA PCR-RFLP方法在属、种水平上聚群较好,16S-23S IGSPCR RFLP反映的多样性介于BOX-PCR和16S rDNA PCR-RFLP之间,能够较好地反映出属、种和亲缘关系很近的菌株间的差异,3种方法聚类分析结果基本一致,可将所有供试菌株分为两大类群,中华根瘤菌属(Sinorhizobium)和慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)。从系统发育来看,供试的快生大豆根瘤菌为费氏中华根瘤菌(Sinorhizobium fredii),慢生大豆根瘤菌为日本慢生大豆根瘤菌(Bradyrhizobium japonicum)和辽宁慢生根瘤菌(Bradyrhizobium liaoningense)。【结论】我国黄土高原地区大豆根瘤菌具有较丰富的遗传多样性,***优势种,慢生大豆根瘤菌仅占10%,同时,分离到2株***。