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box-pcr分子标记对补播紫花苜蓿共生根瘤菌田间竞争结瘤能力的研究

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华北农学报 2011年第1期26卷 187-191页

作者：肖猛刘晓云刘桂霞戴燕燕郭振国郭晓叶魏爽河北大学生命科学学院河北省微生物多样性研究与应用实验室河北保定071002

本研究利用SX01、HB02两株根瘤菌菌株对山西右玉草地补植的紫花苜蓿中苜一号进行了田间接种试验。为了检验根瘤菌菌株的接种效果和筛选高效紫花苜蓿根瘤菌菌株,采用box-pcr分子标记方法对接种根瘤菌菌株的田间竞争结瘤能力进行了研究。... 详细信息

本研究利用SX01、HB02两株根瘤菌菌株对山西右玉草地补植的紫花苜蓿中苜一号进行了田间接种试验。为了检验根瘤菌菌株的接种效果和筛选高效紫花苜蓿根瘤菌菌株,采用box-pcr分子标记方法对接种根瘤菌菌株的田间竞争结瘤能力进行了研究。通过对接种供试菌株及田间分离获得的根瘤菌菌株进行box-pcr及不同菌株之间的box分子指纹图谱比较,检测供试菌株的田间占瘤率。结果表明,紫花苜蓿接种供试菌株60 d后,SX01、HB02两株根瘤菌菌株的田间占瘤率分别达到46.7%,53.3%,说明这两株根瘤菌菌株均具有较强竞争结瘤能力,可以作为高效根瘤菌菌株进行田间推广应用;并阐明了box-pcr作为一种分子标记方法,可对根瘤菌菌株竞争结瘤能力进行研究。

关键词： box-pcr 中苜一号根瘤菌占瘤率

box-pcr技术在微生物多样性研究中的应用

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微生物学通报 2008年第8期35卷 1282-1286页

作者：杨凤环李正楠姬惜珠冉隆贤河北农业大学林学院保定071001 河北农业大学山区研究所保定071000

近年来在微生物多样性研究中,利用微生物基因组中广泛分布的短重复序列设计引物,选择性地扩增重复序列之间的不同基因区域,以得到大小不等的DNA扩增片段的方法日渐增多。以box插入因子(细菌基因组重复序列)为基础的pcr技术,具有操作简... 详细信息

近年来在微生物多样性研究中,利用微生物基因组中广泛分布的短重复序列设计引物,选择性地扩增重复序列之间的不同基因区域,以得到大小不等的DNA扩增片段的方法日渐增多。以box插入因子(细菌基因组重复序列)为基础的pcr技术,具有操作简单快捷,可重复性强,容易获得较为丰富的扩增条带等特点,最初主要应用于细菌的多样性研究。目前研究发现用boxA1R引物对微生物中的真菌、放线菌进行选择性的扩增,也能够达到很好的遗传及多样性分析的目的。本文综述了box-pcr指纹图谱分析技术的特点和一般步骤;结合作者对植物内生细菌的box-pcr指纹图谱分析体系的优化,对box-pcr技术的改进进行了总结;并对该技术在微生物菌株多样性研究领域的应用现状和前景进行了阐述。

关键词： box-pcr 微生物多样性研究

基于box-pcr和REP-pcr技术青枯雷尔氏菌遗传多样性分析

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农业生物技术学报 2011年第6期19卷 1099-1109页

作者：林海云车建美刘波郑雪芳肖荣凤福建省农业科学院农业生物资源研究所福建农林大学生物农药与化学生物学教育部重点实验室

青枯雷尔氏菌(Ralstonia solanacearum)能够对许多重要作物引起致命性萎蔫病害,广泛分布在热带、亚热带以及温带地区。研究青枯雷尔氏菌的遗传多样性对于了解青枯病的发生和流行具有十分重要的意义。本研究利用青枯雷尔氏菌特异性引物鉴... 详细信息

青枯雷尔氏菌(Ralstonia solanacearum)能够对许多重要作物引起致命性萎蔫病害,广泛分布在热带、亚热带以及温带地区。研究青枯雷尔氏菌的遗传多样性对于了解青枯病的发生和流行具有十分重要的意义。本研究利用青枯雷尔氏菌特异性引物鉴定84株来自福建地区不同寄主的青枯雷尔氏菌,结果表明,这些菌株均在504 bp位置出现特异性条带。同时采用box插入因子pcr(box-pcr)和重复基因外回文序列pcr(REP-pcr)对这些菌株进行基因多样性研究,基于它们所扩增出的基因指纹图谱表明,box-pcr扩增出19条特异性条带,REP-pcr扩增出20条特异性条带。系统聚类结果表明,青枯雷尔氏菌的遗传分化与寄主作物和地理来源都存在相关性,其中,寄主植物是在遗传差异中起主导作用。进一步分析可知,地域性的差异主要由box-pcr提供,寄主间的差异主要由REP-pcr提供。不同地理来源的青枯雷尔氏菌在box-pcr中可扩增出各自特异性条带,在REP-pcr中同样具有与各个寄主相对应的特异性条带,利用这些特异性条带可以很容易区分不同寄主以及来源的青枯雷尔氏菌。box-pcr和REP-pcr多态性分析技术可为我国青枯雷尔氏菌基因多样性的研究提供另一条途径。

关键词：青枯雷尔氏菌遗传多样性 box-pcr REP-pcr 菌株鉴定

box-pcr技术在细菌遗传多样性研究中的应用

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中国畜牧兽医 2011年第8期38卷 228-230页

作者：李书光赵蕾张娜王金良陈金龙苗立中沈志强山东省滨州畜牧兽医研究院山东滨洲256618 山东绿都生物科技有限公司山东滨州256600

以box片段(细菌基因组重复序列)为基础的原核生物DNA指纹图谱技术,具有操作简单快捷,可重复性强,容易获得较为丰富的扩增条带等特点。作者综述了box-pcr指纹图谱分析技术的特点和一般步骤,并对该技术在细菌菌株遗传多样性研究领域的应... 详细信息

以box片段(细菌基因组重复序列)为基础的原核生物DNA指纹图谱技术,具有操作简单快捷,可重复性强,容易获得较为丰富的扩增条带等特点。作者综述了box-pcr指纹图谱分析技术的特点和一般步骤,并对该技术在细菌菌株遗传多样性研究领域的应用现状和前景进行了阐述。

关键词： box-pcr 细菌多样性研究

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两株海洋细菌新种的分离及box-pcr鉴定

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海洋环境科学 2011年第5期30卷 622-625页

作者：朱凤玲曲凌云洪旭光孙修勤国家海洋局第一海洋研究所山东青岛266061 国家海洋局海洋生态环境科学与工程重点实验室山东青岛266061

对即墨海参养殖池及即墨盐场的底泥样本进行微生物的可培养研究,获得的两株细菌DQHS13与YCSA40,其与亲缘关系最近的模式菌株Marinobacter zhejiangensis及***的16S rDNA序列相关性分别为98.789%和96.963%,初步判定为海杆菌属(Marinobact... 详细信息

对即墨海参养殖池及即墨盐场的底泥样本进行微生物的可培养研究,获得的两株细菌DQHS13与YCSA40,其与亲缘关系最近的模式菌株Marinobacter zhejiangensis及***的16S rDNA序列相关性分别为98.789%和96.963%,初步判定为海杆菌属(Marinobacter)的新种。采用box-pcr技术分别对这些菌株与其亲缘关系最近的模式菌株进行比较,证实了它们与模式菌株之间DNA指纹图谱存在差异,为下一步的研究提供了一定帮助。

关键词： box-pcr 海杆菌新种鉴定

云南省南苜蓿和天蓝苜蓿根瘤菌box-pcr分析

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安徽农业科学 2009年第12期37卷 5395-5397页

作者：张斌李乔仙刘晓云西南林学院资源学院云南昆明650224 河北大学生命科学学院河北省微生物多样性研究与应用实验室河北保定071002 云南省草地动物科学研究院云南昆明650212

[目的]进行南苜蓿和天蓝苜蓿根瘤菌的box-pcr分析,为苜蓿高效固氮根瘤菌的筛选和接种剂的研究提供理论依据。[方法]采用boxA1R单引物对90株根瘤菌供试菌株及5株标准菌株进行box-pcr分析,并进行聚类分析。[结果]经过扩增得到了较多的条带... 详细信息

[目的]进行南苜蓿和天蓝苜蓿根瘤菌的box-pcr分析,为苜蓿高效固氮根瘤菌的筛选和接种剂的研究提供理论依据。[方法]采用boxA1R单引物对90株根瘤菌供试菌株及5株标准菌株进行box-pcr分析,并进行聚类分析。[结果]经过扩增得到了较多的条带,90株供试菌株共有31种box图谱类型。聚类分析结果显示,所有菌株在40%相似性水平上聚为一群;而在69%的相似性水平上,供试菌株可细分为7个遗传群,群1的菌株全部分离自云南省江川县路居镇天蓝苜蓿的根瘤,群3内的菌株都分离自德宏州盈江县的南苜蓿根瘤,并与标准菌株Enisfer melilotiUSDA1002T聚在一群,在群4、5、6中,除SWF67340的宿主为南苜蓿外,其他菌株的宿主都为天蓝苜蓿,群7中,除SWF66320、SWF67343、SWF65116和SWF673704株菌的宿主为天蓝苜蓿外,其余菌株的宿主都为南苜蓿。[结论]供试菌株具有丰富的遗传多样性,box-pcr能够区分它们之间的差异;大多数菌株按宿主及采集地聚群,但也有交叉。

关键词：根瘤菌 box-pcr 苜蓿南苜蓿天蓝苜蓿

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box-pcr技术在肺炎链球菌检测中应用

实验与检验医学 2010年第3期28卷 209-211页

作者：胡晓彦桂炳东王伶胡龙华贾坤如章白苓南昌大学第二附属医院检验科江西南昌330006

目的建立box-pcr方法 ,用于肺炎链球菌的检测和流行病学调查。方法用box-pcr技术扩增23株肺炎链球菌菌株,并应用50例临床标本检测,同时对方法的特异性、敏感性进行研究。结果对所测肺炎链球菌菌株均获得扩增产物,对其他非肺炎链球菌菌... 详细信息

目的建立box-pcr方法 ,用于肺炎链球菌的检测和流行病学调查。方法用box-pcr技术扩增23株肺炎链球菌菌株,并应用50例临床标本检测,同时对方法的特异性、敏感性进行研究。结果对所测肺炎链球菌菌株均获得扩增产物,对其他非肺炎链球菌菌属无交叉反应,其检测敏感性可达101cfu/ml,50例临床标本box-pcr方法有9例检测出肺炎链球菌阳性(18.0%),而培养法阳性4例(8.0%)。结论 box-pcr方法能快速、特异、灵敏地检测肺炎链球菌和进行流行病学调查。

关键词：肺炎链球菌 box-pcr

基于ITS序列和box-pcr鉴定广叶绣球菌菌株

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中国食用菌 2016年第5期35卷 37-39页

作者：杨驰林衍铨马璐江晓凌应正河福建省农业科学院食用菌研究所福建福州350014 特色食用菌繁育与栽培国家地方联合工程研究中心福建福州350014

广叶绣球菌(Sparassis latifolia)是一种药食兼用的大型真菌,2010年福建省率先实现绣球菌工厂化栽培,并建立了国内第一个绣球菌产业化生产基地,形成绣球菌"科研-基地-示范-销售"的产业化体系。据文献报道,东亚地区有3个绣球菌种,但是生... 详细信息

广叶绣球菌(Sparassis latifolia)是一种药食兼用的大型真菌,2010年福建省率先实现绣球菌工厂化栽培,并建立了国内第一个绣球菌产业化生产基地,形成绣球菌"科研-基地-示范-销售"的产业化体系。据文献报道,东亚地区有3个绣球菌种,但是生产中所应用的菌株,目前并不清楚其种类。利用ITS序列分析了目前广泛使用的5个菌株[SP-A、SP-B、SP-C(闽绣1号)、SP-D、80458],发现其均属于广叶绣球菌,并利用boxpcr技术分析这5个菌株的差异,发现菌株80458与其他4个菌株相比差异很大。

关键词：广叶绣球菌 ITS序列 box-pcr

基于box-pcr和REP-pcr技术的青枯雷尔氏菌多态性分析

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基于BOX-PCR和REP-PCR技术的青枯雷尔氏菌多态性分析