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AsmiR156:沙蓬干旱记忆分子调控网络的潜在枢纽

AsmiR156:potential hub in drought memory molecular regulatorynetwork of Agriophyllum squarrosum

作     者:房庭舟 AWUKU Ibrahim 燕霞 钱朝菊 范兴科 赵鹏姝 廖钰秋 史梁 马小飞 FANG Tingzhou;AWUKU Ibrahim;YAN Xia;QIAN Chaoju;FAN Xingke;ZHAO Pengshu;LIAO Yuqiu;SHI Liang;MA Xiaofei

作者机构:中国科学院西北生态环境资源研究院兰州730030 

出 版 物:《生物学杂志》 (Journal of Biology)

年 卷 期:2024年第41卷第4期

页      面:1-10页

学科分类:0710[理学-生物学] 071010[理学-生物化学与分子生物学] 07[理学] 

基  金:国家自然科学基金项目(31901079,32271695,32201378,32171608) 中国科学院战略生物资源计划(KFJ-BRP-007-015) 

主  题:沙蓬 干旱胁迫 干旱记忆 miRNA 转录组 

摘      要:为探索miRNA-mRNA如何参与沙蓬干旱响应和干旱记忆,选择沙蓬干旱敏感生态型AEX为植物材料,开展3轮干旱-复水循环实验后进行转录组和sRNA测序。分别鉴定出341个和7858个响应干旱胁迫的沙蓬miRNA(DEMIs)和mRNA(DEMs)。DEMI-DEM调控网络构建表明,24个沙蓬DEMIs参与调控1423个DEMs,这些靶基因主要参与细胞分化功能。鉴定出两个干旱记忆miRNA(DMMIs)miR156和miR6173,分别调控11个和6个干旱记忆基因(DMGs)。miR156的靶基因包括3个转录因子(TF)AsRWP-RK、AsC3H11和AsWRKY33;miR6173的靶基因包括两个GST(谷胱甘肽S转移酶)。在先前的研究中,AsC3H11和AsWRKY33作为TF分子开关参与沙蓬干旱记忆分级调控网络,因此,沙蓬miR156可作为“miRNA-转录因子-功能基因网络的候选枢纽。研究解析了沙蓬干旱响应和干旱记忆的分子调控基础,将为荒漠植物中的抗逆遗传资源开发提供理论依据。

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