基于ITS序列的野生猕猴桃遗传多样性研究

作     者：唐玉凤 张露 田虹 赵登梅 王顺富 李慧龙 桑正林 全勇 

作者机构：昭通学院农学与生命科学学院 云南省天麻绿色种植与加工工程研究中心 云南省天麻与真菌共生生物学重点实验室 昭通市苹果产业发展中心 

出 版 物：《西南农业学报》 (Southwest China Journal of Agricultural Sciences)

年 卷 期：2024年

学科分类：09[农学] 0902[农学-园艺学] 090201[农学-果树学] 

基　　金：云南省教育厅科学研究基金项目(2022J0983) 云南省全勇专家基层科研工作站(202305AF60031) 

主　　题：乌蒙山自然保护区 野生猕猴桃 ITS 遗传多样性 系统发育 

摘      要：【目的】探究乌蒙山自然保护区野生猕猴桃（Actinidia chinensis Planch）ITS遗传多样性评价，继而研究其亲缘关系，选育优质的新品种。【方法】采用样线法对乌蒙山自然保护区野生猕猴桃的种类、分布及其生态环境进行调查，并将61份猕猴桃属植物样本进行浅层测序，以 Actinidia callosa ITS区（登录号：AF323803.1）为模板对获得的基因组数据进行ITS区组装，以获得每个样本ITS基因序列数据。【结果】在乌蒙山自然保护区内，野生猕猴桃属植物集中分布在海拔1241.80～1976.42 m，主要生长于灌木丛中或山坡林缘。分类鉴定结果显示，61份猕猴桃样本分别隶属于1个属（猴桃属），7个种。其中，昭通猕猴桃为云南特有种。ITS基因组装后比较分析发现，序列长度在501～650 bp，总GC含量在50.88%～57.72%，变化幅度较大；在5.8S区段相对保守，变异率较小；7个种的遗传距离在0.00309～0.597，总体平均遗传距离为0.302；其中狗枣猕猴桃和昭通猕猴桃亲缘关系较近，遗传距离为0.00309，中华猕猴桃与京梨猕猴桃、显脉猕猴桃、葡萄叶猕猴桃和葛枣猕猴桃的遗传距离较近，介于0.0421～0.0719，而与昭通猕猴桃和狗枣猕猴桃的距离分别为0.588和0.587。系统发育分析结果表明，野生猕猴桃的系统发育较为复杂，存在地理位置相对较远而亲缘关系较近的情况，说明地理位置的远近可以为遗传变异提供变异积累。【结论】乌蒙山自然保护区内猕猴桃科植物多样性丰富，不同种间ITS序列遗传变异位点显著，可为野生猕猴桃种质资源开发利用提供理论基础。