贵州省部分地区微小扇头蜱微生物群落多样性及抗生素抗性基因的宏基因组分析

作     者：管毓威 罗小龙 周敬祝 郑德阳 邓小生 胡勇 梁文琴 

作者机构：贵州医科大学公共卫生与健康学院环境污染与疾病监控教育部重点实验室 贵州省疾病预防控制中心病媒生物监测科贵州省微生物组与传染性疾病防控重点实验室 遵义市疾病预防控制中心病媒生物防制科 道真县疾病预防控制中心 

出 版 物：《中国媒介生物学及控制杂志》 (Chinese Journal of Vector Biology and Control)

年 卷 期：2024年

学科分类：1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学] 

基　　金：贵州省科技计划项目(黔科合支撑一般178) 贵州省传染病预防与控制人才基地科研团队-媒介生物及相关传染病监测预警中心(RCJD2107) 

主　　题：微小扇头蜱 微生物群落多样性 宏基因组 抗生素抗性基因 

摘      要：目的 了解贵州省微小扇头蜱体内微生物群落和抗生素抗性基因（ARGs）的携带情况。方法 2022-2023年4、5月使用动物体表检蜱法采集贵州省道真、紫云和修文县以及盘州市牛体表微小扇头蜱，将收集到的蜱标本按地区分组，每个地区随机选取15只雌蜱，分为3管进行宏基因组测序。测序结果经数据质控、拼接组装等操作后与美国国立生物技术信息中心（NCBI）非冗余蛋白库和抗性基因数据库（SARG）比对，获得各样本物种和ARGs注释信息。然后通过R 3.6.3软件和GraPhlAn 1.1.3软件进行可视化分析，包括物种组成、ARGs组成和组间相似性分析等。结果 共采集到550只吸血微小扇头蜱，其中雌蜱404只，雄蜱85只，若蜱61只。微小扇头蜱的优势菌门为变形菌门，平均相对丰度为60.01%，其次为厚壁菌门（36.76%）；优势菌属为克雷伯氏菌属（38.58%），其次为葡萄球菌属（22.00%）；优势菌种为肺炎克雷伯菌（38.58%），其次为金黄色葡萄球菌（21.90%），此外还检出了嗜吞噬细胞无形体、福尼尔立克次体、康氏立克次体、日本立克次体、伽氏疏螺旋体和贝氏柯克斯体等蜱携病原体，分别占3.08%、3.04%、0.76%、0.70%、0.01%和0.01%。组间相似性分析结果显示，组间差异大于组内差异（R=0.586,P=0.002）。ARGs注释发现与β-内酰胺类（54.22%）、氨基糖苷类（20.18%）、氯霉素类（13.61%）和多药类（11.99%）抗生素抗性相关的3 316个基因，各地区ARGs种类和丰度不同。结论 贵州省微小扇头蜱体内微生物菌群组成丰富，体内病原体种类较多，同时携带大量ARGs，应加强蜱微生物群及其抗性基因的研究，指导合理用药和预防蜱传疾病的发生。