虹鳟倍性鉴定SSR标记筛选与应用研究

作     者：马海兵 黄天晴 徐革锋 刘恩慧 谷伟 王高超 郭福元 董福霖 郑龙华 张黎黎 姜再胜 王炳谦 MA Haibing;HUANG Tianqing;XU Gefeng;LIU Enhui;GU Wei;WANG Gaochao;GUO Fuyuan;DONG Fulin;ZHENG Longhua;ZHANG Lili;JIANG Zaisheng;WANG Bingqian

作者机构：中国水产科学研究院黑龙江水产研究所冷水鱼类产业技术创新战略联盟黑龙江哈尔滨150070 烟台经海海洋渔业有限公司山东烟台264006 安徽省桐城市水产服务中心安徽桐城231400 

出 版 物：《渔业科学进展》 (Progress in Fishery Sciences)

年 卷 期：2024年第45卷第4期

页      面：43-52页

核心收录：

学科分类：08[工学] 0836[工学-生物工程] 

基　　金：财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系(CARS-46) 中国水产科学研究院基本科研业务费项目(2020TD32)共同资助 

主　　题：虹鳟 鲑科鱼类 微卫星 三倍体 倍性检测 

摘      要：虹鳟(Oncorhynchusmykiss)是我国冷水性鱼类的主要养殖品种。与二倍体相比,虹鳟三倍体具有生长速度快、肉质好和不育等优点。目前,鉴定虹鳟倍性主要是通过流式细胞术进行DNA含量分析,但这种方法需要采集鱼类血液或组织样本,会对其造成伤害。为了实现利用微创方法收集样本鉴定虹鳟倍性,本研究利用PCR扩增以及电泳分离技术对153个微卫星标记(SSR标记)进行分析,其中139个SSR标记能够在二倍体和三倍体中成功扩增,筛选出132个SSR标记具有多态性,最终鉴定出7个标记在三倍体中表现出较高的变异性。通过在52个已知倍性水平的参考样本和48个未知倍性的样本上进行验证,进一步从中筛选出3个SSR标记(SSR1054、SSR1056和SSR1468)足以区分倍性水平,并且根据3个标记序列重新设计了3对具有良好稳定性的引物序列进行倍性分析应用。本研究所筛选的SSR标记解决了现有虹鳟倍性鉴定中存在的技术流程复杂、耗材昂贵的问题,并有助于不同倍性虹鳟的遗传多样性研究。