VEGFR2抑制剂的虚拟筛选、分子动力学模拟及活性验证

作     者：王培莉 杨娟 曾宣 蒯振彧 

作者机构：马鞍山职业技术学院医学护理系 

出 版 物：《今日药学》 (Pharmacy Today)

年 卷 期：2024年

学科分类：1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100701[医学-药物化学] 10[医学] 

基　　金：安徽省高校自然科学研究项目(KJ2021A1340) 安徽省高校自然科学研究项目(2022AH052970) 

主　　题：血管内皮生长因子受体2 虚拟筛选 分子动力学模拟 活性验证 

摘      要：目的 运用计算机辅助药物设计技术，将中药小分子化合物与血管内皮生长因子受体2（Vascular Endothelial Growth Factor Receptor2，VEGFR2）进行虚拟筛选。方法 使用 Discovery Studio 2023软件的对蛋白进行模型评估，运用虚拟筛选技术进行高通量筛选和精准筛选，并对筛选出的中药化合物分子进行ADMET性质预测，并对优选化合物进行体外活性测试，利用分子对接分析化合物与VEGFR2蛋白的相互作用模式，并对最优化合物进行分子动力学模拟。结果 筛选出9个与VEGFR2蛋白具有高结合能力的化合物，其中苦参酚E、新乌拉尔醇和败酱苷B对VEGFR2蛋白有较强的亲和作用，Kd值分别为21、10、和25 μmol·L-1，抗肿瘤实验表明新乌拉尔醇对人胃癌细胞 SGC7901的抑制活性优于5-氟尿嘧啶，并与VEGFR2蛋白之间形成了多个氢键的结合模式，动力学模拟显示新乌拉尔醇与VEGFR2蛋白结合牢固。结论 筛选得到的新乌拉尔醇具有作为VEGFR2蛋白小分子抑制剂的潜力，为新型VEGFR2抑制剂的发现提供参考。