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大麦核仁蛋白基因HvNOP58的克隆和表达分析

作     者:王梦玥 罗振蒙 詹开旺 毛孝强 周洪斌 魏红霞 高洪铭 陈升位 

作者机构:云南农业大学农学与生物技术学院 沾益区植保植检站 

出 版 物:《麦类作物学报》 (Journal of Triticeae Crops)

年 卷 期:2024年

核心收录:

学科分类:09[农学] 0901[农学-作物学] 

基  金:国家自然科学基金项目(32060457,32360469) 云南省科技厅基础研究专项重点项目(202201AS070066) 

主  题:大麦 核仁蛋白 基因克隆 亚细胞定位 表达分析 

摘      要:Nop(nucleolar protein)结构域蛋白可参与核糖体装配、核苷酸甲基化修饰和基因表达调控等生物进程,是制约真核生物发育遗传、细胞周期调控和衰老机制等研究的关键因素,但少有大麦Nop结构域核仁蛋白基因的报道。本研究以北青7号和Ynbs突变体为材料,克隆了大麦HvNOP58基因的CDS序列。结果表明,HvNOP58基因位于大麦Chr2H基因组负链的49 019 790~49 023 604 bp区间,具有10个外显子,编码区长度为1 674 bp。所编码蛋白属于亲水性的稳定蛋白,其高级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,具有N端结构域、NOSIC结构域和Nop结构域。同源比对和系统进化分析表明,HvNOP58蛋白与同族物种的核仁蛋白具有更近的亲缘关系。基于亚细胞定位、RT-PCR检测和荧光定量检测结果表明,HvNOP58基因定位于细胞核,在叶、茎、幼穗、根和叶鞘5种组织中有表达。本研究为大麦核仁蛋白基因的标记开发、功能验证和作用机制解析等提供了新基因资源。

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