新冠病毒非结构蛋白氨基酸变异与疾病严重程度的关系探究

作     者：边紫薇 李东 黄小丽 徐映华 王茜 刘书洁 胡贵方 王海鹰 BIAN Zi-wei;LI Dong;HUANG Xiao-li;XU Ying-hua;WANG Qian;LIU Shu-jie;HU Gui-fang;WANG Hai-ying

作者机构：南方医科大学公共卫生学院流行病学系 

出 版 物：《现代预防医学》 (Modern Preventive Medicine)

年 卷 期：2024年第51卷第11期

页      面：2094-2099页

学科分类：1004[医学-公共卫生与预防医学(可授医学、理学学位)] 100401[医学-流行病与卫生统计学] 10[医学] 

基　　金：国家自然科学基金青年科学基金(31800146) 

主　　题：SARS-CoV-2 疾病严重程度 氨基酸变异 非结构蛋白 新冠病毒感染 

摘      要：目的 本研究旨在探讨严重急性呼吸综合征冠状病毒2型（severe acute respiratory syndrome corona coronavirus 2,SARS-CoV-2）非结构蛋白氨基酸变异是否与新型冠状病毒感染（corona virus disease 2019,COVID-19）疾病严重程度有关。方法 对全球共享流感数据倡议组织（GISAID）数据库得到的数据进行分析，筛选SARS-CoV-2序列中突变频率较高的非结构蛋白氨基酸突变。将患者结果分为轻症和重症，采用χ2检验比较组间基线特征，逻辑回归检验选择的突变与患者预后之间的关系。结果 共纳入数据23 498例，其中男性11 444例（48.70%），女性12 054例（51.30%），中位数年龄[M（P25,P75）]为38（26,53）岁。男性新冠病毒感染重症率高于女性（χ2=226.564,P0.001）；随着年龄增加（χ2=6 088.032,P0.001），新冠病毒感染重症率增加。发病年份（χ2=1 604.070,P0.001）、大洲（χ2=4 520.240,P0.001）与新冠病毒感染严重程度显著相关。确定了SARS-CoV-2基因组中几种可能与新冠病毒感染严重程度相关的氨基酸变异，NSP4＿T492I（aOR=0.574, 95%CI:0.487～0.676）、NSP12＿G671S （aOR=0.657, 95%CI:0.458～0.941）、NSP6＿T77A（aOR=0.422, 95%CI:0.235～0.759）、NSP3＿P1228L （aOR=0.124, 95%CI:0.080～0.190）与新冠病毒感染重症呈负相关，而NSP12＿P323L （aOR=2.126, 95%CI:1.531～2.953）、NSP13＿P77L （aOR=1.923, 95%CI:1.115～2.369）、NSP14＿A394V（aOR=20.486, 95%CI:9.649～43.495）与新冠病毒感染重症呈正相关。结论 SARS-CoV-2非结构蛋白氨基酸变异可能与新冠病毒感染严重程度相关，需要进一步验证筛选可能与新冠病毒感染严重程度相关的非结构蛋白氨基酸变异。