基于SSR分子标记的紫苏种质资源遗传多样性及群体结构分析

作     者：向依 潘金卫 李慧琳 奉斌 杨航 袁婷婷 于二汝 XIANG Yi;PAN Jinwei;LI Huilin;FENG Bin;YANG Hang;YUAN Tingting;YU Erru

作者机构：贵州省农业科学院油料研究所 

出 版 物：《种子》 (Seed)

年 卷 期：2024年第43卷第5期

页      面：40-47+2页

学科分类：1008[医学-中药学(可授医学、理学学位)] 10[医学] 

基　　金：贵州省科技支撑项目“贵州山区特色油料资源利用研究及实验平台建设”[黔科中引地(2020)4012号] 贵州省农科院青年基金项目“贵州紫苏优异种质资源发掘以及遗传多样性分析”[黔农科院青年基金(2021)05号] “紫苏资源核心种质及其SSR指纹图谱的研究”(黔农科青年基金(2023)13号) “紫苏油加工及副产品综合利用的关键技术研究与示范”(黔科合支撑一般183) 

主　　题：紫苏 遗传多样性 SSR标记 群体结构分析 

摘      要：为了明确不同紫苏种质的遗传基础和群体的亲缘关系，本研究利用19对SSR分子标记对不同地理来源的141份紫苏资源进行遗传多样性和群体结构分析。结果表明，19对SSR分子标记扩增出80条多态性条带，平均每对引物4.26条，多态性指数(PIC)变幅在0.331 1～0.845 7之间，平均为0.620 6,多态性条带占比85.10%。利用UPGMA法对141份紫苏进行分子聚类，遗传相似系数(GS)介于0.478 7～0.948 9之间，平均为0.709 9,在GS=0.696处将供试材料分为三类。通过Structure群体结构分析，将供试材料分为三大类，其中68.8%的紫苏种质资源遗传背景比较单一，31.2%的资源拥有混合血统，其遗传背景较为复杂。