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铁炮百合‘萨莉’鳞茎各发育时期及不同组织qPCR内参基因筛选和验证

Selection and Validation of Reference Genes for qPCR in'Sally'Across Stages and Tissues

作     者:张达 李莲莲 吴学尉 王天喜 刘海英 李缘 王丽花 Zhang Da;Li Lianlian;Wu Xuewei;Wang Tianxi;Liu Haiying;Li Yuan;Wang Lihua

作者机构:云南大学农学院昆明650504 云南省农业科学院花卉研究所昆明650205 

出 版 物:《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期:2024年第22卷第13期

页      面:4297-4303页

学科分类:090706[农学-园林植物与观赏园艺] 0907[农学-林学] 09[农学] 

基  金:云南省科技计划项目“低纬高原月季等切花无土栽培技术集成与示范”(202102AE090001) 云南省科技厅“珠芽黄魔芋优良品种培育与产业化示范”项目(202004AC10001-A06)共同资助 

主  题:铁炮百合杂交系 内参基因 qPCR geNorm 百合 

摘      要:为筛选铁炮百合杂交系鳞茎不同发育阶段以及相同发育阶段不同组织中稳定表达的内参基因,本研究以铁炮百合观赏品种‘萨莉’为研究对象,采用实时荧光定量PCR (qPCR)分析百合的6个候选的内参基因(ACT, BHLH, EF1, EIF, GAPDH, lilyact)在‘萨莉’鳞片的不同发育时期以及不同组织中的扩增效率,再使用Normfinder、Bestkeeper、ge Norm、比较ΔCt法以及RefFinder 5种软件或方法对候选内参基因的表达稳定性进行评估。结果表明在所有样品中和在不同发育阶段的鳞茎中都是EIF和BHLH综合稳定性最佳,在不同组织中GAPDH和EIF的综合稳定性最佳,而在所有样品中及不同组织中,ACT的稳定性最差。本研究所得结果为‘萨莉’鳞茎的不同发育阶段以及不同组织的表达量分析提供了合适的内参基因组合,为其后续基因表达量的研究提供了基础。

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