我国罕见G9P[8]-A2基因型重配株轮状病毒全基因组分子特征分析

作     者：熊光萍 彭蕊 王萌璇 魏宇航 范佳欣 唐晓苹 王宏 章青 庞立丽 孔翔羽 李希希 李丹地 Xiong Guangping;Peng Rui;Wang Mengxuan;Wei Yuhang;Fan Jiaxin;Tang Xiaoping;Wang Hong;Zhang Qing;Pang Lili;Kong Xiangyu;Li Xixi;Li Dandi

作者机构：传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室国家卫生健康委医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206 甘肃中医药大学公共卫生学院甘肃兰州730000 

出 版 物：《疾病监测》 (Disease Surveillance)

年 卷 期：2024年第39卷第5期

页      面：586-591页

核心收录：

学科分类：1005[医学-中医学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学] 

基　　金：国家重点研发计划(No.2022YFC2304302,No.2018YFC1200602) 国家自然科学基金(No.21934005)。 

主　　题：A组轮状病毒 全基因组 测序 G9P 变异 重配 

摘      要：目的了解我国1株G9P[8]基因型A组轮状病毒(RVA)JL18221140的全基因组分子特征。方法对我国吉林省1例G9P[8]基因型RVA(JL18221140)原始粪便标本采用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)一步法扩增11个基因节段,并通过DNAStar,MEGA 11.0等生物信息分析软件进行同源性及进化分析。结果JL18221140的全基因组11个节段的基因型为G9-P[8]-I1-R1-C1-M1-A2-N1-T1-E1-H1,NSP1基因型呈现DS-1样特征。系统发育分析显示VP7和VP4分别聚集在谱系G9-VI和P[8]-Ⅲ中。结论JL18221140为G9P[8]基因型中罕见的G9P[8]-A2重配株,该基因型可能是由中国流行的G9P[8]-A1和G2P[4]-A2毒株共感染过程中基因组间重配产生的。表明对RVA持续监测并对全基因组测序的重要性,有利于了解我国RVA毒株的遗传变异情况,为今后病毒的防控和疫苗的研发提供更有效的基础数据。