利用邻近标记-质谱联用技术筛选埃博拉病毒相关宿主因子

作     者：张迅 柏宇 刘海楠 刘萱 曹诚 ZHANG Xun;BAI Yu;LIU Hainan;LIU Xuan;CAO Cheng

作者机构：安徽大学物质科学与信息技术研究院合肥230601 军事科学院军事医学研究院北京100850 

出 版 物：《生物学杂志》 (Journal of Biology)

年 卷 期：2024年第41卷第3期

页      面：92-97页

学科分类：0710[理学-生物学] 1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 07[理学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 071005[理学-微生物学] 10[医学] 

基　　金：中国科学院武汉国家生物安全实验室高端用户培育项目(2022ACCP-MS04) 国家科技重大专项(2018ZX09711003-005-005) 

主　　题：邻近标记 埃博拉病毒 病毒包涵体 TurboID VP35 

摘      要：构建VP35与生物素连接酶TurboID融合蛋白,利用埃博拉病毒最小基因组系统(Ebola virus minigenome system, EBOV MG),在细胞中模拟病毒的生命周期和病毒包涵体(virus inlusion body, VIB)的形成过程,通过添加外源生物素,标记VP35相互作用蛋白。定量质谱丰度差异分析筛选出537个潜在的VP35互作蛋白,Gene Ontology(GO)分析发现其中包括大量与RNA结合相关蛋白。从中选取EIF4B和ZNF598进行初步验证,二者均与VP35存在相互作用,且敲低上述基因可显著抑制EBOV转录复制病毒样颗粒(trVLP)的复制效率。结果证实,邻近标记-质谱联用技术可以用于病毒-宿主相互作用蛋白挖掘,为病毒致病机制研究及抗病毒靶点挖掘提供重要手段。