彩色马铃薯响应UV-B辐射的转录组分析

作     者：董秋菊 吴晓杰 张晓龙 肖继坪 DONG Qiu-ju;WU Xiao-jie;ZHANG Xiao-long;XIAO Ji-ping

作者机构：云南农业大学农学与生物技术学院昆明650201 虎跳峡镇农业综合服务中心云南香格里拉674402 

出 版 物：《西南农业学报》 (Southwest China Journal of Agricultural Sciences)

年 卷 期：2024年第37卷第4期

页      面：697-706页

学科分类：09[农学] 0901[农学-作物学] 

基　　金：国家自然科学基金项目(32060500) 云南省基础研究计划-面上项目(202301AT070501) 云南省农业基础研究联合专项-重点项目(202301BD070001-135) 云南省“兴滇英才支持计划”青年人才项目(YNWR-QNBJ-2020-138) 

主　　题：彩色马铃薯 UV-B辐射 转录组 差异表达 转录因子 

摘      要：[目的]探究彩色马铃薯对UV-B辐射具有较强耐受性的机理,通过转录组分析马铃薯对UV-B辐射响应的分子机制,为筛选马铃薯耐UV-B辐射相关基因提供理论依据。[方法]以彩色马铃薯‘花心洋芋’为试验材料,对全生育期进行UV-B辐射处理,选取成熟期的块茎,采用Illumina HiseQ2500平台进行测序分析。[结果]共得到232 285 320个有效测序读长数,且与参考基因组比对率超过78.5%,GC含量均超过42.1%。通过分析筛选到843个差异表达基因(DEGs),包括544个上调基因和299个下调基因。GO功能分析表明,‘花心洋芋’的DEGs主要富集在代谢过程、细胞组分和催化活性。KEGG富集分析发现,‘花心洋芋’主要通过代谢途径中的碳水化合物代谢通路来响应UV-B辐射,转录因子主要是ARR-B、AP2-EREBP、MADS、bHLH和NAC等,与响应光信号和环境胁迫相关。[结论]‘花心洋芋’响应UV-B辐射的主要通路为代谢途径中的碳水化合物代谢通路,转录因子ARR-B、AP2-EREBP、MADS、bHLH和NAC均起到一定的调控作用。