基于潘多拉测序探索劳力性热射病小鼠脑组织非编码小RNA的变化
Study of small non-coding RNA changes in brain tissue of exertional heat stroke mice based on Pandora sequencing作者机构:北部战区总医院急诊医学科辽宁沈阳110016
出 版 物:《中国急救医学》 (Chinese Journal of Critical Care Medicine)
年 卷 期:2024年第44卷第6期
页 面:503-508页
核心收录:
学科分类:1004[医学-公共卫生与预防医学(可授医学、理学学位)] 100402[医学-劳动卫生与环境卫生学] 10[医学]
基 金:辽宁省科技计划项目(2023020987-JH2/1017)
摘 要:目的基于潘多拉测序探索劳力性热射病(EHS)小鼠脑组织非编码小RNAs(sncRNAs)的变化。方法将12只雄性健康C57BL/6J小鼠随机分为对照组(n=6)和模型组(n=6)。对照组小鼠不作处理,模型组小鼠采用恒温恒湿箱内跑步建立EHS模型。EHS模型建立后基于脑湿干重检测和HE染色明确EHS小鼠脑损伤。采用潘多拉测序进行组间差异sncRNAs筛选。结果EHS小鼠脑组织通过PANDORA-Seq共检测2722个sncRNA;与正常对照组比较,以fold change2、P0.05为筛选条件,EHS小鼠脑组织共鉴定到53个显著差异sncRNA,如mmu-miR-1843b-5p、mmu-miR-490-3p、mmu-miR-1843a-5p、piR-mmu-7796454和tsRNA-1020-MetCAT等;基于小RNA注释软件SPORTS1.1发掘和注释sncRNAs,提供了长度分布图和种类分布雷达图。sncRNAs种类的差异分析和序列的差异分析结果采用热图和火山图展示。结论sncRNAs失调可能参与EHS小鼠脑损伤的发病机制。