平菇基因组InDel标记开发及杂交菌株遗传多样性分析

作     者：夏会楠 李东晓 冯璠 孙悦 王春霞 郑素月 XIA Huinan;LI Dongxiao;FENG Fan

作者机构：河北工程大学园林与生态工程学院河北邯郸056038 

出 版 物：《食用菌》 (Edible Fungi)

年 卷 期：2024年第46卷第3期

页      面：37-41页

学科分类：0710[理学-生物学] 071010[理学-生物化学与分子生物学] 07[理学] 09[农学] 0902[农学-园艺学] 090202[农学-蔬菜学] 

基　　金：河北省现代农业产业技术体系食用菌创新团队建设专项资金(HBCT2023090207) 河北省农业科技成果转化项目(202360101010014) 

主　　题：重测序 InDel标记 交配型鉴定 变异菌株 遗传多样性分析 

摘      要：以1株平菇白色变异菌株以及黑色出发菌株为试验材料,采用全基因组重测序技术对两个菌株进行重测序,针对InDel变异位点设计17对引物对两个菌株的孢子单核菌株及杂交菌株进行遗传多样性分析。结果表明:重测序获得平菇白色变异菌株1 763 Mb高质量数据,平菇黑色出发菌株1 779 Mb高质量数据,在平菇白色变异菌株检测到331 099个InDel变异位点,在平菇黑色出发菌株中检测到339 682个InDel变异位点。随机选择InDel变异位点并设计引物进行PCR扩增试验,最终选择17对引物对变异菌株的单核菌株以及杂交菌株进行PCR扩增,研究其遗传多样性;结果 17对引物中P4、P7、P8、P9、P14菌株具有明显的多态性。进一步对12个平菇杂交菌株进行扩增,共扩增出30条清晰条带,其中扩增条带最多的引物是P9菌株,共扩增出9条条带,扩增引物最少是P14菌株,扩增出3条条带,多态性位点占66%。用5对引物对12份材料进行遗传多样性分析,发现平菇P9菌株扩增条带中多数材料均能在760 bp处扩增出多态性条带。