基于GEO数据库、网络药理学及分子对接探讨扶脾柔肝颗粒治疗肝癌的作用机制

作     者：肖玉洪 安祯祥 XIAO Yu-Hong;AN Zhen-Xiang

作者机构：贵州中医药大学第一临床医学院贵州贵阳550002 贵州中医药大学第一附属医院 

出 版 物：《中国老年学杂志》 (Chinese Journal of Gerontology)

年 卷 期：2024年第44卷第10期

页      面：2336-2343页

学科分类：1008[医学-中药学(可授医学、理学学位)] 1006[医学-中西医结合] 100602[医学-中西医结合临床] 10[医学] 

基　　金：国家自然科学基金项目(82160893,81760865) 国家中医药管理局第五批全国中医临床优秀人才研修项目(国中医药人教函1号) 贵州中医药大学中医脾胃病科技创新人才团队建设(贵中医TD合字005号) 

主　　题：GEO数据库 网络药理学 分子对接 扶脾柔肝颗粒 肝癌 

摘      要：目的采用GEO数据库、网络药理学和分子对接探讨扶脾柔肝颗粒(FRG)治疗肝细胞癌(HCC)的物质基础及其作用机制。方法首先,通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)、GEO数据库获取FRG治疗HCC的活性成分与潜在靶点。其次,使用Cytoscape软件构建“中药-活性成分-潜在靶点网络,利用Network Analyzer插件筛选关键成分。采用String数据库和Cytoscape软件构建潜在靶点蛋白质互作(PPI)网络,利用CytoNCA插件筛选核心靶点。使用Metascape数据库对潜在靶点进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析和基因本体论(GO)功能富集分析。最后,采用AutoDock Vina软件将关键成分与核心靶蛋白进行分子对接。通过KM Plotter数据库分析核心靶基因对HCC患者总生存率(OS)的影响。结果预测结果显示FRG与HCC有63个共同靶点。“中药-活性成分-潜在靶点网络分析显示关键成分为山奈酚、β-谷甾醇、汉黄芩素等;PPI网络分析显示核心靶点为雌激素受体(ESR)1、雄激素受体(AR)、前列腺素G/H合酶(PTGS)2、原癌基因MYC、原癌基因FOS。KEGG富集分析主要涉及癌症通路、p53通路、白细胞介素(IL)-17通路和缺氧诱导因子(HIF)-1通路等。分子对接结果显示关键成分与核心靶点之间具有较强的亲和力。核心基因的OS分析结果显示,与肝癌中ESR1基因高表达比较,ESR1低表达的OS明显更低(P0.05)。结论FRG通过多成分、多靶点和多途径对HCC发挥治疗作用,为下一步实验研究提供理论依据。