马铃薯StXTH9基因生物信息学及其干旱胁迫下表达分析

作     者：孟涛 马艳红 武小娟 吴娟 王沛捷 鲁思琪 李楠 刘金泉 

作者机构：内蒙古农业大学农学院 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2024年

学科分类：09[农学] 0901[农学-作物学] 

基　　金：内蒙古自然科学基金(2022JQ06) 内蒙古农业大学基本科研业务费专项(BR22-11-16) 呼和浩特市科技计划项目(2022-农-10)共同资助 

主　　题：马铃薯 XTH基因 生物信息学分析 RT-qPCR 

摘      要：木葡聚糖内转糖苷酶/水解酶(XTH)在植物生长发育、细胞壁重构、抗逆等过程中发挥着重要的作用。为研究XTH基因在马铃薯抗旱过程中发挥的作用，本研究从马铃薯全基因组中筛选获得1个StXTH基因，并对其进行生物信息学分析。结果表明：StXTH9蛋白由296个氨基酸组成，分子质量为33.87 kD，等电点为6.04，属于亲水性蛋白，定位于细胞壁中；外显子数量为4个，位于马铃薯第7条染色体上。二级结构以无规则卷曲为主，三级结构具有符合XTH结构域特征。StXTH9基因具有跨膜螺旋、信号肽和磷酸化位点。StXTH9基因的顺式作用元件与抗逆、脱落酸等激素和光响应有关；利用RT-qPCR对模拟干旱胁迫下的StXTH9基因表达分析可知，在品种‘克新1号’和‘大西洋’中，StXTH9基因的表达量在0 h最高，且随着干旱处理时间的延长整体呈现下降趋势，推测该基因在干旱胁迫下呈负调控。本研究为后续深入研究马铃薯StXTH9基因的生物学功能奠定基础。