宏基因组二代测序在非HIV感染患者耶氏肺孢子菌肺炎诊疗中的应用

作     者：祝颖 张利平 朱明辉 刘颖 夏显鑫 何玮琳 程真顺 王德新 ZHU Ying;ZHANG Liping;ZHU Minghui;LIU Ying;XIA Xianxin;HE Weilin;CHENG Zhenshun;WANG Dexin

作者机构：武汉大学中南医院呼吸与危重症医学科湖北武汉430071 武汉大学中南医院社会医疗发展部湖北武汉430071 武汉大学中南医院心血管内科湖北武汉430071 蕲春县人民医院呼吸与危重症医学科湖北蕲春435300 

出 版 物：《武汉大学学报（医学版）》 (Medical Journal of Wuhan University)

年 卷 期：2024年第45卷第5期

页      面：576-581,588页

学科分类：1010[医学-医学技术（可授医学、理学学位）] 10[医学] 

基　　金：武汉大学中南医院医学人才攀登计划(编号:PDJH202205) 

主　　题：宏基因组二代测序 耶氏肺孢子菌肺炎 聚合酶链反应 混合感染 

摘      要：目的:探讨宏基因组二代测序(mNGS)在非人类免疫缺陷病毒(HIV)感染患者中耶氏肺孢子菌肺炎(PJP)的诊断价值和其对治疗的指导价值。方法:采用回顾性研究方法,共纳入武汉大学中南医院2017年1月至2022年7月非HIV感染PJP患者73例和诊断为非PJP患者70例。分析了支气管肺泡灌洗液(BALF)中耶氏肺孢子菌(PJ)和其他共病原体情况,以临床复合诊断为参考标准,比较mNGS、聚合酶链式反应(PCR)和血清1,3‑β‑D‑葡聚糖(BDG)在PJP中的诊断效能,将纳入研究的PJP患者根据是否行mNGS分为行mNGS组和未行mNGS组,通过非参数秩和检验对比两组治疗情况。结果:本研究共纳入非HIV感染PJP患者73例,其中46例患者行mNGS检测,统计分析结果显示,相较于PCR、BDG,mNGS在诊断非HIV感染PJP的灵敏度(97.8%)和特异度(95.2%)更高。同时,mNGS在混合感染的检出率明显高于传统病原学检测(87.0%vs 63.0%,P=0.018),其中以白色念珠菌、人类疱疹病毒5型(CMV)、人类疱疹病毒1型(HSV1)最为常见。并且,在46例患者mNGS结果回报后,71.7%的PJP患者对最初的治疗方案进行了调整,其中57.6%患者经调整治疗方案后好转出院。与未行mNGS检测的非HIV感染PJP患者相比,行mNGS的患者住院时间更短[16(9,24)d vs 26(16,41)d],抗生素疗程更短[12(6,16)d vs 20(11,31)d],差异均有统计学意义(均P0.05)。结论:mNGS对非HIV感染PJP的诊断效能高,且对于共病原体检出具有更好的性能,对临床诊断和指导针对性抗感染药物治疗具有一定的价值。