绵羊MYL基因家族的鉴定与组织表达分析

作     者：杨杨 余乾 刘昱成 杨华 赵卓 王立民 周平 杨庆勇 代蓉 YANG Yang;YU Qian;LIU Yucheng;YANG Hua;ZHAO Zhuo;WANG Limin;ZHOU Ping;YANG Qingyong;DAI Rong

作者机构：新疆农垦科学院省部共建绵羊遗传改良与健康养殖国家重点实验室石河子832000 华中农业大学信息学院武汉430070 

出 版 物：《畜牧兽医学报》 (ACTA VETERINARIA ET ZOOTECHNICA SINICA)

年 卷 期：2024年第55卷第4期

页      面：1551-1564页

核心收录：

学科分类：0905[农学-畜牧学] 09[农学] 090501[农学-动物遗传育种与繁殖] 

基　　金：兵团农业创新工程(NCG202221) 省部共建绵羊遗传改良与健康养殖国家重点实验室重大项目(2021ZD01) 省部共建绵羊遗传改良与健康养殖国家重点实验室建设(2022CA002) 

主　　题：绵羊 MYL 基因家族 生物信息学分析 基因表达 

摘      要：为了解肌球蛋白轻链(myosin light chain,MYL)基因家族在绵羊中的分子进化关系及表达变化,本研究利用生物信息学方法对绵羊MYL基因家族进行鉴定和系统分析。各选取了3只军垦白肉羊、新疆细毛羊和湖羊成年公羊各组织样品,采用qRT-PCR方法验证家族成员MYL1、MYL6B和MYLPF基因的表达情况。结果显示,12个MYL基因分布在9条染色体上,编码由147~211氨基酸组成的亲水性蛋白质,无信号肽和跨膜结构域,二级结构以α-螺旋为主。根据基因结构、保守结构域和基序分布等特征,可以将这些基因家族成员分为3个组。共线性分析结果表明,MYL2和MYL10、MYL2和MYLPF存在片段复制,且这些片段受到较强的选择压力。蛋白互作网络显示MYH10与绵羊MYL家族成员均存在互作关系。MYLs的组织表达模式差异较大,其中MYL1、MYL2、MYL6B和MYLPF在骨骼肌组织中高水平表达。基因克隆测序结果显示,扩增得到目的基因的CDS全长,qRT-PCR结果表明,MYL1、MYL6B和MYLPF在军垦白肉羊肌肉组织中的表达水平显著高于其他组织(P0.0001),并且在军垦白肉羊骨骼肌中的表达水平显著高于湖羊和细毛羊(P0.0001)。以上结果为深入研究绵羊MYL基因家族的功能以及优化绵羊肉用性能提供了线索。