娄门鸭胸肌性状相关指标的全基因组关联分析

作     者：刘宏祥 沈永杰 张丽华 周腾彬 刘小倩 章双杰 朱春红 朱静 陈晓颖 黄学成 宋卫涛 陶志云 王志成 徐文娟 李慧芳 LIU Hongxiang;SHEN Yongjie;ZHANG Lihua;ZHOU Tengbin;LIU Xiaoqian;ZHANG Shuagnjie;ZHU Chunhong;ZHU Jing;CHEN Xiaoying;HUANG Xuecheng;SONG Weitao;TAO Zhiyun;WANG Zhicheng;XU Wenjuan;LI Huifang

作者机构：江苏省家禽科学研究所江苏扬州225125 昆山市畜牧兽医站江苏苏州215300 

出 版 物：《中国家禽》 (China Poultry)

年 卷 期：2024年第46卷第4期

页      面：8-14页

学科分类：0905[农学-畜牧学] 09[农学] 090501[农学-动物遗传育种与繁殖] 

基　　金：江苏省种业振兴“揭榜挂帅”项目(JBGS111、JBGS030) 江苏省现代农业(水禽)产业技术体系(JATS404) 

主　　题：鸭 胸肌 全基因组关联分析 单核苷酸多态性 

摘      要：为寻找与鸭胸肌性状相关的候选基因,鉴定鸭胸肌性状相关分子标记,试验以199只娄门鸭为试验材料,采集血液提取DNA,用基因组重测序方法进行基因分型,利用PLINK 1.90对分型结果进行质控后,采用rMVP软件中的FarmCPU模型对SNPs(Single nucleo⁃tide polymorphisims)与胸宽、胸深、胸肌重和胸肌率4个性状指标做GWAS分析,定位出显著位点。结果显示:与胸宽相关的SNPs位点有4个,位于1、11、18号染色体上;与胸肌重相关的SNPs位点有2个,位于2、3号染色体上;与胸肌率相关的SNPs位点有2个,位于2号染色体上。通过基因功能注释,这些位点对应的胸肌性状候选基因有8个,分别是LOC119715526、RLBP1、ABHD2、KYAT1、SPOUT1、LOC101800569、EVA1A和NOL4。研究表明,在不同染色体上共鉴定到8个与胸肌性状显著相关的SNPs位点,这些位点共涉及8个候选基因。